Sequenciação de Nova Geração

A CD Genomics insiste em oferecer serviços de sequenciação de nova geração (NGS) de alta qualidade a investigadores em todo o mundo.

O que é NGS

O NGS, também conhecido como sequenciação de alto rendimento, é uma tecnologia de sequenciação de DNA que revolucionou a investigação genómica e molecular e influenciou todos os campos da investigação biológica, tornando-se cada vez mais prevalente na sociedade moderna. O NGS permite-nos sequenciar DNA e RNA de forma muito mais precisa, rápida e económica.

Sequenciação de bibliotecas é uma técnica que abrange o passo inicial de anexar adaptadores, que incluem elementos como sequências de índice, códigos de barras e regiões de ligação de primers de sequenciação, a ambas as extremidades dos fragmentos-alvo desejados. Subsequentemente, estes fragmentos preparados são submetidos a sequenciação utilizando um sequenciador dedicado. Em contraste, sequenciação direcionada é caracterizada pela captura seletiva de genes ou regiões de interesse antes da fase de sequenciação. Notavelmente, os principais métodos para executar a sequenciação direcionada incluem a captura híbrida e a PCR multiplex.

Serviços de NGS na CD Genomics

Com os nossos muitos anos de experiência, a CD Genomics é um fornecedor líder de serviços de NGS para fornecer sequenciação avançada e soluções de bioinformática para os seus clientes globais. Equipado com uma vasta gama de tecnologias de ponta e apoiado por um grupo de profissionais experientes, a CD Genomics está comprometida em oferecer um serviço completo que inclui design experimental, isolamento de DNA, fragmentação de DNA, preparação de bibliotecas, sequenciação e bioinformática. Como resultado, entregamos resultados rápidos, rentáveis e de alta qualidade que permitem aos investigadores alcançar avanços científicos.

Estamos a oferecer ambas as plataformas de sequenciação da Illumina, PacBio Tempo Real de Moléculas Únicas (SMRT) e Tecnologias de nanoporo para atender a uma ampla gama de objetivos de pesquisa e ao seu orçamento.

As nossas tecnologias e produtos foram validados através de múltiplas parcerias com instituições académicas, empresas de diagnóstico e laboratórios de testes.

As nossas Soluções de NGS Incluem:

Sequenciação Genómica

O sequenciamento do genoma é a metodologia utilizada para empregar técnicas de sequenciamento de DNA de alto rendimento juntamente com ferramentas avançadas de bioinformática para a compilação e análise tanto dos constituintes funcionais como estruturais de um genoma completo. Esta abordagem abrangente facilita o exame de disparidades e distinções individuais dentro das populações. Além disso, ao executar sequenciação de novo e ao aproveitar metodologias de bioinformática, torna-se possível derivar mapas genéticos para várias espécies.

Transcriptómica

O termo "transcriptoma" abrange a totalidade dos transcritos gerados pelas células ou tecidos de uma determinada espécie sob condições específicas. Aproveitando o sequenciamento de alta capacidade de segunda geração, torna-se viável adquirir de forma eficiente e extensiva dados de sequência relativos a quase todos os transcritos e informações sobre a expressão diferencial de genes nos tecidos ou órgãos de uma espécie específica sob condições particulares. Esta abordagem tem encontrado ampla utilidade em diversos domínios, abrangendo investigação fundamental, diagnósticos clínicos e investigação e desenvolvimento farmacêutico.

Epigenómica

A epigenética, frequentemente referida como epigenómica, epitranscriptómica ou pós-genética, abrange a investigação de modificações duradouras na expressão génica ou nas características celulares que se manifestam através de mecanismos específicos, tudo sem modificar a sequência de DNA. Este domínio de investigação encontra aplicação nos campos da biologia e em disciplinas genéticas especializadas.

Genómica Microbiana

A sequenciação do microbioma abrange o processo de amplificação dos segmentos notavelmente variáveis de microrganismos. 16S rDNA, 18S rDNA e ITS, sucedido pelo sequenciamento de alto rendimento. Esta metodologia facilita a análise da composição de espécies e das variações na abundância relativa entre bactérias, arqueias, fungos e outros microrganismos presentes em um determinado ambiente. Oferece informações valiosas sobre a estrutura das comunidades microbianas, conexões evolutivas, bem como as inter-relações entre microrganismos e o seu entorno em amostras ambientais.

Sequenciação metagenómica, pelo contrário, implica a análise da constituição genómica de comunidades microbianas em ambientes distintos, utilizando técnicas de sequenciação de alto rendimento. Esta abordagem facilita a exploração da diversidade microbiana, dinâmicas populacionais, funcionalidade genética, redes metabólicas e conexões evolutivas. Além disso, permite a investigação das atividades funcionais dentro das comunidades microbianas, interações entre vários microrganismos e as suas interações com o ambiente circundante. A investigação em sequenciação metagenómica supera os desafios associados à cultura e isolamento de microrganismos, alargando o âmbito de utilização dos recursos microbianos e oferecendo um instrumento eficaz para a análise das comunidades microbianas ambientais.

Além disso, também fornecemos serviços de sequenciação de leitura longa

Sequenciação SMRT da PacBio

O sequenciador PacBio Sequel é a mais recente plataforma de sequenciamento de terceira geração da Pacific BioSciences, utilizando a tecnologia de sequenciamento em Tempo Real de Molécula Única (SMRT). Apresenta um comprimento médio de leitura de até 15 quilobases (Kb), com as leituras mais longas a estenderem-se até 40-60 Kb. O sistema de sequenciamento é composto por 16 módulos de sequenciamento de células SMRT, cada um capaz de produzir 5-10 gigabases (Gb) de dados. Notavelmente, a tecnologia SMRT permite o sequenciamento de moléculas de DNA individuais sem a necessidade de amplificação, mitigando efetivamente o viés de GC induzido por PCR e garantindo uma cobertura de sequência abrangente e uniforme. Atualmente, a tecnologia de sequenciamento SMRT da PacBio encontra aplicações generalizadas na montagem de genomas complexos e transcriptoma completo sequenciação de organismos eucariotos.

Sequenciação por Nanoporos

A sequenciação por nanoporo, como o nome sugere, baseia-se fundamentalmente na utilização de um nanoporo—um pequeno poro com adaptadores moleculares ligados covalentemente. A proteína do nanoporo está firmemente fixada a uma membrana, com uma proteína dinâmica que passa ácidos nucleicos através do nanoporo. À medida que um ácido nucleico atravessa o nanoporo, induz mudanças na carga, causando assim flutuações na corrente na membrana. Devido ao diâmetro extremamente estreito dos nanoporos, apenas polímeros de ácidos nucleicos individuais podem passar. Como as propriedades de carga elétrica das bases individuais ATCG diferem, a interferência que geram na corrente ao passar pela proteína do nanoporo varia. Ao monitorizar e decifrar continuamente estes sinais de corrente, é possível determinar a sequência de bases, permitindo assim a sequenciação.

A CD Genomics utiliza a plataforma Nanopore para realizar milhares de projetos de sequenciação de genomas bacterianos e metagenomas, incluindo a análise de dados. Também realizamos milhares de sequenciações de transcriptomas completos e sequenciações de RNA Direto, juntamente com a análise de dados subsequente.

Outros

Vantagens dos Nossos Serviços de NGS:

Pessoal altamente experiente e qualificado
Instrumentos de última geração e tecnologias de ponta
Controlo de qualidade rigoroso
Solução de NGS personalizada e bioinformática adaptada às suas necessidades de investigação.
Design de estratégia profissional
. Ampla gama de aplicações
. Preço competitivo

Navegando para aprender como podemos ajudá-lo a alcançar os seus objetivos de investigação através das tecnologias NGS. Para mais informações, por favor, contacte-nos! Os nossos especialistas de nível Ph.D. líderes da indústria estão sempre dedicados a fornecer apoio abrangente e resolução técnica de problemas o mais rapidamente possível.

Apenas para fins de investigação, não se destina a diagnóstico clínico, tratamento ou avaliações de saúde individuais.

Publicações

Whole-Transcriptome Analysis in Peripheral Blood Mononuclear Cells from Patients with Lipid-Specific Oligoclonal

Biomedicines | 2020

https://doi.org/10.3390/biomedicines8120540

Threonine fuels glioblastoma through YRDC-mediated codon-biased translational reprogramming

Nature Cancer | 2024

https://doi.org/10.1038/s43018-024-00748-7

Restriction endonuclease cleavage of phage DNA enables resuscitation from Cas13-induced bacterial dormancy

Nature microbiology | 2023

https://doi.org/10.1038/s41564-022-01318-2

Sarecycline inhibits protein translation in Cutibacterium acnes 70S ribosome using a two-site mechanism

Nucleic Acids Research | 2023

https://doi.org/10.1093/nar/gkad103