Diretrizes para Submissão de Amostras
O que é a Análise Multi-Ómica?
Análise multi-óptica é uma abordagem de biologia de sistemas que integra múltiplas camadas moleculares—genómica, transcriptómica, epigenómica, proteómicae metabolómica—para gerar uma visão abrangente dos mecanismos biológicos. Ao contrário dos estudos de omicas únicas que se concentram em um domínio molecular, multi-ómica captura a comunicação entre genes, transcritos, proteínas e metabolitos, permitindo uma modelagem mais precisa da função biológica, progressão da doença e resposta terapêutica.
Quer esteja a descobrir circuitos regulatórios no câncer, a otimizar características de culturas ou a perfilar interações entre hospedeiros e micróbios, a análise de dados multi-ômicos proporciona uma compreensão mais profunda e mais reproduzível do sistema.
Principais Vantagens das Abordagens Multi-Ómicas:
- Decodifica interacções complexas para além dos limites de uma única ómica.
- Valida cruzadamente os resultados entre camadas biológicas para uma maior precisão.
- Permite a descoberta de biomarcadores multimodais e assinaturas de vias.
- Oferece alta sensibilidade para detectar alvos críticos de baixa abundância.
- Suporta tanto a pesquisa orientada por hipóteses como a pesquisa baseada na descoberta.
Por que a Multi-Ómica Está a Transformar a Biociência Moderna
A integração de dados ómicos diversos tornou-se essencial tanto em ambientes académicos como industriais. Desde descoberta biomédica para genómica agrícola e ciência ambiental, integração multi-ómica permite conclusões de pesquisa mais precisas, acelerando a inovação e reduzindo o risco de desenvolvimento.
Investigação Biomédica e Desenvolvimento de Medicamentos
- Identificar fatores específicos da doença em camadas genómicas, transcriptómicas e epigenómicas.
- Prever alvos terapêuticos e mecanismos de resistência
- Acompanhar a resposta ao tratamento e a modulação imunitária utilizando ómicas longitudinais
Estudos de Plantas, Microbioma e Ambiente
- Melhorar a tolerância ao stress e as características de rendimento através de melhoramento orientado por ómicas
- Descobrir interacções solo–planta–microbioma utilizando a integração de amplicon + metabolómica.
Monitorizar poluentes ambientais através de perfis biomoleculares em múltiplos níveis.
Estratégias de Integração Multi-Ómica
Transcritosómica + Metabolómica
Esta estratégia de dupla camada liga a expressão gênica a alterações metabólicas a montante, oferecendo tanto perspectivas causais como fenotípicas. Ideal para:
- Estudos de crescimento e desenvolvimento
- Perfilagem da resposta imunitária
- Pesquisa sobre resistência ao stress
- Descoberta de biomarcadores em doenças crónicas
Transcriptómica + Proteómica
Explore a cascata completa da regulação genética ao analisar a expressão de mRNA e proteína em conjunto. Esta abordagem capta tanto a atividade transcricional como a modulação pós-transcricional, revelando eventos regulatórios ocultos.
- Revelar gargalos de tradução e caminhos compensatórios
- Compare correlações gene-para-proteína sob stress ou doença.
- Melhorar a validação de biomarcadores com evidência a nível de proteína
Epigenómica + Transcriptómica + Genómica
Esta abordagem tri-ómica oferece uma visão panorâmica da regulação genética—conectando variantes de sequência, modificações epigenéticas (como a metilação do DNA e marcas de histonas) e a expressão gênica a jusante.
- Mapear regiões regulatórias que controlam a ativação de genes.
- Caracterizar subtipos de cancro e estágios de desenvolvimento.
- Identificar variantes associadas a doenças em regiões não codificantes
Ferramentas Populares:
WGBS, RRBS, ChIP-seq, RNA-seqe sequenciação do genoma completo (WGS)
Sequenciação de Amplicons + Metabolómica
Especialmente concebido para estudos do microbioma, esta combinação revela como as populações microbianas influenciam o metabolismo do hospedeiro ou do ambiente.
- Estudo da modulação do microbioma intestinal das vias imunes do hospedeiro
- Acompanhar comunidades microbianas do solo que impulsionam o ciclo do nitrogénio.
- Identificar metabolitos microbianos correlacionados com estados de doença.
Exemplo de Caso de Uso:
Ligação Sequenciação do rRNA 16S da flora intestinal com alterações metabolómicas na produção de ácidos gordos de cadeia curta.
Cada projeto é apoiado por uma equipa de bioinformática dedicada que o ajudará a:
- Selecione combinações ómicas ótimas
- Desenhe um estudo que suporte tanto a descoberta como a validação.
- Integrar dados públicos (por exemplo, TCGA, GEO) para melhorar a interpretabilidade.
Bioinformática e Análise de Dados Personalizadas
Dos Dados Multi-Ómicos Brutos à Compreensão Biológica
Na CD Genomics, reconhecemos que o sequenciamento é apenas o primeiro passo. O verdadeiro valor de análise multi-óptica está na interpretação de dados—traduzir terabytes de informação bruta em significado biológico acionável. É aí que a nossa soluções de bioinformática personalizadas entra.
A nossa equipa de especialistas—composta por biólogos moleculares, estatísticos e cientistas de dados—trabalha lado a lado consigo para personalizar cada etapa analítica, garantindo que a sua análise de dados multi-ômicos alinha-se com a sua hipótese biológica, desenho do estudo e objetivos de publicação.
Por que a Bioinformática Personalizada é Importante
Os fluxos de trabalho padronizados podem ignorar eventos regulatórios subtis ou interações em todo o sistema. A CD Genomics oferece pipelines totalmente personalizados para:
- Integrar conjuntos de dados heterogéneos (por exemplo, RNA-seq + ChIP-seq + LC-MS)
- Alinhar dados ómicos com bases de dados públicas (TCGA, GEO, ENCODE)
- Construir redes regulatórias e metabólicas
- Descobrir genes condutores, interruptores epigenéticos e alvos terapêuticos.
- Correlacionar assinaturas moleculares com fenótipos clínicos ou resposta ao tratamento.
A nossa abordagem equilibra a relevância biológica e o rigor estatístico—providenciando resultados que são reproduzíveis, perspicazes e prontos para revisão por pares.
Capacidades Analíticas Fundamentais
| Tipo de Análise | Entregas Principais |
|---|---|
| Expressão Diferencial / Abundância | Gráficos de vulcão, mapas de calor, tabelas de mudança de fold |
| Integração Multi-Ómica | MOFA, matrizes de correlação, análise de clusters |
| Enriquecimento de Vias e GO | KEGG, Reactome, STRING, GSEA |
| Construção de Rede | Redes de genes TF, mapas de interação de proteínas |
| Metilação e Perfilagem Epigenética | DMRs, mapas de acessibilidade da cromatina (ATAC-seq) |
| Descoberta de Biomarcadores | Marcadores preditivos associados a doenças, características ou respostas |
| Mineração de Bases de Dados Públicas | Reanotação e co-análise de dados GEO/TCGA |
| Mapeamento de Associação Clínica | Análise de sobrevivência, infiltração imune, pontuação de risco |
Fluxo de trabalho
Por que escolher a CD Genomics
Um Parceiro Confiável para a Descoberta Multi-Ómica
Infraestrutura Tecnológica Avançada
- Plataformas de Sequenciamento: Illumina NovaSeq, PacBio Sequel II, MGI DNBSEQ e Oxford Nanopore
- Pronto para Multi-Ómicas: Desde WGS e RNA-seq até ChIP-seq, ATAC-seq, LC-MS/MS e RRBS
- Automação e Vazão: Capacidade de alto volume para estudos ómicos em grande escala
Equipa de Bioinformática e Biologia de Sistemas Especializada
- Especialistas multifuncionais em oncologia, microbiologia, ciências das plantas e ciência de dados.
- Pipelines personalizados para integração de dados multi-ômicos, mineração de bases de dados públicas (TCGA, GEO) e interpretação de vias.
- Relato de qualidade para publicação com visualizações e insights regulatórios
Ecossistema de Serviço Flexível e de Ponta a Ponta
- Apoio a projetos de single-omics e multi-omics em qualquer fase.
- Fluxo de trabalho de uma só paragem: QC da amostra → preparação da biblioteca → sequenciação → QC dos dados → integração → relatório
- Co-desenvolvimento de estratégias de dados para alvos inovadores, investigação translacional e planeamento de publicações.
Interpretação de Dados de Alto Impacto
- Incorporar metadados clínicos, controlos experimentais e correlações de fenótipos.
- Uso de ferramentas avançadas: MOFA, DESeq2, STRING, KEGG, Cytoscape e algoritmos de aprendizagem automática.
- Métricas de QC padronizadas e estruturas de reprodutibilidade integradas em todos os projetos.
Apoio Orientado para Investigadores
- Gestores de projeto bilíngues e consultores com doutoramento disponíveis durante todo o projeto.
- Assistência na preparação de manuscritos para revistas SCI, submissão a revistas e respostas a revisores.
- Parcerias de longo prazo com CROs, laboratórios académicos e inovadores farmacêuticos.
Exposição de Pósteres para Download
RNA-seq, ATAC-seq e Triagem CRISPR
Potenciar a Investigação em Células T CAR através de Multi-Ómicas
Descubra como dados integrados de transcriptómica, epigenómica e triagem funcional revelam os mecanismos de exaustão das células T.
Integração de ChIP-seq e RNA-seq
Mecanismos de Decodificação nas Células-Tronco do Cancro Pancreático
Explore como o perfilamento de dual-ômica identifica reguladores epigenéticos e alterações transcricionais em populações de CSC.
Requisitos de Amostra
Processos Simplificados. Resultados de Alta Qualidade.
Aceitamos os seguintes tipos de amostras para projetos de multi-ômica:
- Genómica: DNA genómico (≥1 μg, OD260/280 = 1.8–2.0)
- Transcritos: RNA total (≥2 μg, RIN ≥7)
- Epigenómica: Extratos de DNA ou cromatina de alta qualidade
- Proteómica: Lisados celulares/tecidos ou proteínas purificadas (≥100 μg)
- Metabolómica: Biofluidos, tecidos, pellets microbianos (congelados rapidamente, ≥100 mg ou 200 μL)
Por favor, consulte a nossa equipa técnica para requisitos específicos de espécies ou formatos personalizados.
Perguntas Frequentes sobre o Serviço de Multi-Ómicas
Q1: Que tipos de ómicas podem ser integrados num único projeto?
Apoiamos combinações flexíveis de genómica, transcriptómica, epigenómica, proteómica e metabolómica. Pode escolher entre 2 a 5 camadas com base na sua questão biológica e nos objetivos do projeto.
Q2: Posso fornecer os meus próprios dados de sequenciação para integração?
Sim. Aceitamos conjuntos de dados externos em formatos padrão e podemos integrá-los com dados ómicos recém-gerados ou bases de dados públicas (por exemplo, TCGA, GEO) como parte de um plano de análise personalizado.
Q3: Que tipos de questões de investigação podem as multi-ómicas ajudar a responder?
A análise multi-ômica é ideal para descobrir mecanismos regulatórios, identificar biomarcadores, caracterizar subtipos de doenças, compreender respostas ao stress ou imunes, e mapear interacções entre o hospedeiro e o microbioma.
Q4: Quais entregas irei receber?
Você receberá um relatório completo com tabelas de dados anotadas, gráficos interativos, diagramas de vias, mapas de rede e figuras visuais prontas para publicação. Os arquivos de dados brutos e processados estão incluídos.
Q5: Como garante a qualidade e a reprodutibilidade dos dados?
Aplicamos um controlo de qualidade rigoroso em cada etapa—avaliação de amostras, sequenciação, pré-processamento de dados e modelagem estatística. A validação cruzada entre camadas ómicas melhora a fiabilidade e reduz o ruído.
Q6: Pode ajudar com a preparação de manuscritos ou análise posterior?
Sim. Oferecemos suporte opcional para a redação de manuscritos, formatação de figuras e respostas a revisões por pares. Também disponibilizamos serviços de mineração de dados e interpretação alargados mediante solicitação.
Q7: Como devo começar um projeto de multi-ómi cas?
Basta entrar em contacto connosco com os seus objetivos de projeto e os tipos de amostras disponíveis. A nossa equipa científica ajudará a desenhar a estratégia ómica ideal e orientá-lo-á através da submissão de amostras e do planeamento do fluxo de trabalho.
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