Introdução
A era da genómica assistiu a avanços notáveis nas tecnologias de sequenciação, permitindo que os investigadores aprofundem as complexidades do genoma. Uma dessas inovações é o advento da sequenciação de longas leituras, que oferece vantagens sem precedentes na captura de variações estruturais, splicing alternativo e expressão de isoformas de genes. A CD Genomics, uma empresa líder na área da genómica, apresenta com orgulho o seu serviço de Análise de Dados de Sequenciação de Longas Leituras (LRS).
Análise Bioinformática de Dados de Sequenciação de Longas Leituras
A sequenciação de longas leituras (sequenciação por nanopore e sequenciação em tempo real de molécula única (SMRT)) gera leituras de sequenciação prolongadas, revolucionando a nossa capacidade de explorar a intrincada paisagem do genoma. No entanto, a análise destes extensos conjuntos de dados apresenta desafios únicos. A CD Genomics, com a sua vasta experiência em análise bioinformática, utiliza ferramentas e pipelines computacionais de ponta para superar esses desafios e extrair insights valiosos dos dados de sequenciação de longas leituras.
Visão geral das ferramentas e pipelines de análise de longas leituras.
Controlo de Qualidade e Correção de Erros
Dados de alta qualidade são vitais para uma análise precisa a montante. A CD Genomics emprega rigorosas medidas de controlo de qualidade para avaliar a integridade dos dados de sequenciação de longas leituras. Através de um trimming e filtragem meticulosos, garantimos a remoção de artefatos e leituras de baixa qualidade, aumentando a fiabilidade das análises subsequentes.
Expressão de Genes/Isoformas de Genes
A sequenciação de longas leituras permite a análise abrangente da expressão de genes e da diversidade de isoformas. A CD Genomics utiliza algoritmos e ferramentas sofisticadas para quantificar com precisão os níveis de expressão de genes e isoformas. Isso facilita a identificação de genes e isoformas diferencialmente expressos em várias condições, lançando luz sobre processos biológicos cruciais e mecanismos regulatórios.
Descoberta de Novos Genes e Identificação de Isoformas de Comprimento Total
Descobrir novos genes e isoformas de comprimento total é fundamental para expandir a nossa compreensão do genoma. A CD Genomics aproveita métodos avançados de montagem de transcriptoma para reconstruir estruturas completas de genes e identificar novos genes e isoformas com alta precisão. Ao aproveitar o poder da sequenciação de longas leituras, o nosso serviço facilita a descoberta de genes e variantes de transcritos anteriormente não anotados.
Deteção de Genes de Fusão De Novo e Perfis de Expressão de Isoformas de Fusão
Genes de fusão, formados por rearranjos genómicos, desempenham um papel crucial no câncer e em outras doenças. A CD Genomics utiliza algoritmos e pipelines especializados para detectar genes de fusão e determinar os seus perfis de expressão. Através da análise aprofundada de isoformas de fusão, o nosso serviço ajuda a desvendar os mecanismos subjacentes ao desenvolvimento e progressão da doença.
Expressão Específica de Alelos e Haplotipagem
Compreender a expressão específica de alelos e haplótipos é vital para desvendar as complexidades das variações genéticas. A CD Genomics oferece uma análise precisa dos dados de sequenciação de longas leituras para desvendar padrões de expressão específica de alelos e haplótipos. Esta informação fornece insights sobre a regulação da expressão gênica e o impacto das variações genéticas em características fenotípicas.
Montagem de Genoma De Novo
A montagem de genoma de novo é um passo crucial na decifração de genomas complexos, particularmente em organismos não modelo. A CD Genomics utiliza algoritmos de montagem de ponta otimizados para dados de sequenciação de longas leituras para reconstruir montagens de genoma de alta qualidade. Isso permite a identificação de variações estruturais, anotações de genes e análises em todo o genoma com uma precisão excepcional.
Montagem de Transcriptoma De Novo
A CD Genomics fornece serviços abrangentes de montagem de transcriptoma de novo utilizando dados de sequenciação de longas leituras. Aproveitando algoritmos avançados, reconstruímos isoformas de transcritos de comprimento total, descobrimos eventos de splicing alternativo e fornecemos anotações precisas de genes. Isso capacita os investigadores a obter insights mais profundos sobre a paisagem transcriptómica e decifrar as complexidades da regulação gênica.
Chamada de Metilação, Posicionamento de Nucleossomas e Acessibilidade da Cromatina
As modificações epigenéticas desempenham um papel fundamental na regulação gênica e no desenvolvimento de doenças. A CD Genomics oferece uma análise abrangente dos dados de sequenciação de longas leituras para identificar padrões de metilação de DNA, determinar o posicionamento de nucleossomas e a acessibilidade da cromatina. Ao analisar os dados de sequenciação de longas leituras, a CD Genomics pode mapear com precisão as posições dos nucleossomas e avaliar a acessibilidade da cromatina em todo o genoma. Esta informação fornece insights valiosos sobre a regulação gênica, a estrutura da cromatina e o impacto das modificações epigenéticas nos processos celulares.
Vantagens do Serviço de Análise de Dados de Sequenciação de Longas Leituras da CD Genomics
Precisão e Exatidão Inigualáveis: A nossa equipa experiente garante os mais altos padrões de análise de dados, entregando resultados precisos e exatos.
Soluções Personalizadas de Análise de Dados: Adaptamos os nossos pipelines de análise para atender aos seus objetivos de pesquisa específicos, fornecendo soluções personalizadas para os requisitos únicos do seu projeto.
Pipelines de Bioinformática de Ponta: Utilizamos pipelines de bioinformática de última geração otimizados para a análise de dados de sequenciação de longas leituras, incorporando os mais recentes algoritmos e ferramentas.
Relatórios e Interpretação Abrangentes: O nosso serviço inclui relatórios de análise detalhados e interpretações claras dos resultados, permitindo que você derive insights significativos dos dados.
Tempo de Resposta Eficiente: Priorizamos resultados atempados sem comprometer a qualidade, garantindo que você receba os resultados da sua análise dentro dos prazos acordados.
Confidencialidade e Segurança dos Dados: Mantemos protocolos rigorosos de gestão de dados e empregamos medidas de segurança robustas para garantir a confidencialidade e integridade dos seus dados de sequenciação.
Ao escolher o Serviço de Análise de Dados de Sequenciação de Longas Leituras da CD Genomics, você tem acesso a uma análise precisa e personalizada, pipelines de bioinformática de ponta, relatórios abrangentes, tempos de resposta eficientes e segurança dos dados, capacitando-o a avançar na sua pesquisa genómica com confiança.
Apenas para fins de investigação, não se destina a diagnóstico clínico, tratamento ou avaliações de saúde individuais.
Diretrizes para Submissão de Amostras
