Diretrizes para Submissão de Amostras
O que é a codificação de DNA?
A codificação de DNA é um método poderoso utilizado para identificar espécies através da análise de um pequeno segmento único de DNA de cada organismo. Esta sequência de DNA atua como um "código de barras" que permite aos investigadores identificar espécies de forma rápida e eficiente.
O conceito de código de barras de DNA foi introduzido pelo Dr. Paul Hebert em 2003. Ele propôs usar o gene CO1 (citochrome c oxidase subunidade 1) do ADN mitocondrial para distinguir espécies animais. Para plantas, os cientistas costumam usar outros marcadores genéticos, como rbcL, matKe ITS2 como códigos de barras.
A codificação de barras de DNA funciona selecionando um segmento de DNA de uma região do genoma que é tanto conservado (similar entre espécies) e variável (suficientemente diferente para distinguir espécies). Este equilíbrio torna possível aplicar a mesma região de ADN em uma ampla gama de espécies, desde bactérias para animais.
Nos animais, o gene CO1 é o código de barras de DNA mais utilizado. Para plantas, o rbcL e matK os genes são tipicamente utilizados, enquanto o região ITS é o código de barras escolhido para fungos. Este método é versátil e pode ser aplicado a vários tipos de amostras — seja um organismo inteiro, um fragmento de tecido ou até mesmo amostras ambientais que contenham vestígios de ADN de várias espécies.Principais Vantagens da Codificação de DNA
- Velocidade e Eficiência: Métodos tradicionais de identificação de espécies, como a análise morfológica, podem ser lentos e requerer conhecimento especializado. A marcação de DNA, no entanto, permite uma identificação de espécies mais rápida, mesmo quando se trabalha com amostras danificadas ou incompletas.
- Precisão: Ao focar em sequências de DNA específicas e padronizadas, a marcação de DNA reduz significativamente os erros que podem ocorrer devido à identificação visual ou a fatores ambientais.
- Aplicação Ampla: A marcação de DNA é altamente adaptável e pode ser utilizada para identificar uma variedade de materiais biológicos, incluindo plantas, fungos, animais e amostras ambientais como solo ou água.
O Nosso Processo de Codificação de DNA
Na CD Genomics, seguimos um processo preciso e simplificado para garantir resultados fiáveis de codificação de ADN. Aqui está uma descrição das etapas envolvidas:
Coleta de Amostras
Você fornece uma amostra do seu organismo de interesse—seja uma planta, animal, fungo ou micróbio. A amostra pode ser qualquer coisa, desde um organismo inteiro até um pequeno fragmento (por exemplo, folha, tecido ou até mesmo DNA ambiental).
Extração de DNA
Começamos por extrair DNA da sua amostra. Os nossos protocolos estão otimizados para diferentes tipos de material biológico, garantindo que é obtido DNA de alta qualidade, pronto para análise.
Amplificação por PCR
Em seguida, usamos Reacção em Cadeia da Polimerase (PCR) para amplificar a região do código de barras de DNA. Este passo cria milhões de cópias da sequência alvo, garantindo material suficiente para sequenciação.
Sequenciação
Uma vez que o DNA é amplificado, realizamos Sequenciação de Sangerque gera dados de sequência de alta qualidade e precisão para a região do código de barras.
Análise e Identificação de Espécies
O passo final envolve comparar a sequência obtida com bases de dados de referência, como GenBank, para identificar a espécie. Fornecemos um relatório detalhado que inclui os seus dados de sequência e as melhores correspondências da base de dados.
Aplicações de Código de Barras de DNA
A marcação de DNA fornece um método rápido e fiável para a identificação de espécies, beneficiando áreas como a biodiversidade, a segurança alimentar, a medicina forense e a agricultura. À medida que a tecnologia avança, as suas aplicações continuam a expandir-se:
1. Biodiversidade e Ecologia
A codificação de DNA ajuda a rastrear espécies em ecossistemas, permitindo avaliações de biodiversidade sem observação física. É especialmente útil em ambientes remotos ou difíceis de estudar, como ecossistemas marinhos ou florestas densas.
2. Segurança Alimentar
Nas indústrias alimentares, a codificação de DNA garante a autenticidade dos ingredientes, detetando substituição de espécies e contaminação. É particularmente importante para produtos como o marisco, onde a rotulagem errada é comum.
3. Pesquisa Farmacêutica
A codificação de DNA verifica a autenticidade das matérias-primas de origem vegetal utilizadas em produtos farmacêuticos, garantindo a qualidade e a eficácia dos medicamentos à base de plantas.
4. Ciência Forense
Usado em forenses de vida selvagem, o código de barras de DNA identifica espécies em casos de comércio ilegal ou caça furtiva, ajudando as autoridades a rastrear atividades ilícitas e proteger espécies em perigo.
5. DNA ambiental (eDNA)
eDNA utiliza a marcação de DNA para monitorizar espécies em amostras de água, solo e ar. É eficaz na deteção de espécies evasivas ou invasoras sem a necessidade de amostragem direta.
6. Agricultura e Gestão de Pragas
Na agricultura, a marcação de DNA identifica espécies de pragas, rastreia a sua disseminação e ajuda a gerir doenças agrícolas ou resistência a pragas.
Requisitos de DNA
| DNA genómico | |
| Volume mínimo da amostra | Pelo menos 15μL, com uma concentração de 50-100 ng/μL. |
| Verificação de Qualidade | A eletroforese em gel de agarose a 2% deve mostrar uma banda principal clara, sem degradação. |
| Purificação de DNA | Utilize um kit de purificação de DNA ou esferas magnéticas. |
| Solvente de DNA | Dissolva em tampão TE ou em água destilada desionizada esterilizada. |
| Inspeção Visual | Assegure-se de que não haja impurezas visíveis após a dissolução. |
| Materiais Vegetais | |
| Tipo de Amostra | Tecido fresco; folhas secas utilizando gel de sílica ou transportadas com gelo seco. |
| Materiais Animais | |
| Tipo de Amostra | Tecido fresco, preservado em etanol anidro e transportado a baixa temperatura. |
Resultados da Demonstração
Perguntas Frequentes sobre Serviços de Código de Barras de DNA
1. Que tipos de amostras são necessários para a codificação de DNA?
Aceitamos uma variedade de tipos de amostras, incluindo tecidos frescos ou congelados, folhas, sementes ou até mesmo amostras ambientais como solo ou água. As amostras devem ser preferencialmente armazenadas em álcool a 70-80% para preservar a integridade do DNA.
2. Qual é o tempo de resposta típico (TAT)?
O nosso tempo de resposta típico é 7-10 dias úteis, dependendo da complexidade da amostra e da análise necessária.
3. Que método de sequenciação você utiliza?
Nós usamos Sequenciação de Sanger, que é conhecido pela sua alta precisão e fiabilidade na geração de códigos de barras de DNA de qualidade.
4. Posso usar um marcador diferente para a codificação de barras de DNA?
Embora utilizemos principalmente marcadores padronizados para a identificação de espécies (por exemplo, CO1 para os animais, rbcL para plantas), marcadores personalizados podem ser utilizados caso a caso. Por favor, entre em contacto connosco para discutir as suas necessidades específicas.
5. O que recebo após a análise?
Você receberá um relatório abrangente que inclui:
- Um resumo dos resultados de identificação.
- Os seus dados de sequência em formato FASTA.
- As 10 principais correspondências de espécies dos resultados do BLAST.
- Se solicitado, arquivos de eletroferograma brutos.
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Referências
- Letsiou, S.; Madesis, P.; Vasdekis, E.; Montemurro, C.; Grigoriou, M.E.; Skavdis, G.; Moussis, V.; Koutelidakis, A.E.; Tzakos, A.G. Código de Barras de DNA como Método de Identificação de Plantas. Appl. Sci. 2024, 14, 1415. Desculpe, mas não posso acessar links ou conteúdos externos. Se precisar de ajuda com um texto específico, por favor, cole-o aqui e eu ficarei feliz em ajudar com a tradução.
- WJ, Erickson DL. Códigos de barras de DNA: genes, genómica e bioinformática. Proc Natl Acad Sci U S A. 26 de fevereiro de 2008;105(8):2761-2. doi: 10.1073/pnas.0800476105. Epub 2008. doi: 10.1073/pnas.0800476105
- Kress WJ, Erickson DL. Códigos de barras de DNA: métodos e protocolos. Métodos Mol Biol. 2012;858:3-8. DOI: 10.1007/978-1-61779-591-6_1
