Diretrizes para Submissão de Amostras
O que é Sequenciação do Genoma Completo?
O Sequenciamento de Genoma Completo (WGS) é uma tecnologia de ponta, tecnologia de alto rendimento que lê a sequência completa de DNA de um organismo — incluindo genes codificadores, regiões não codificadoras e variações estruturais em grande escala. Captura tudo, desde alterações de uma única base (SNVs) até rearranjos genómicos complexos (SVs), tornando-se o método mais completo disponível na pesquisa genómica moderna.
O WGS suporta duas abordagens principais:
- Montagem de novo: Ideal para espécies recém-sequenciadas sem um genoma de referência, ajudando a resolver regiões de repetição complexas.
- Resequenciamento: Detecta SNPs, inserções/deleções (InDels) e alterações estruturais com base em um genoma de referência conhecido.
Ao contrário dos métodos baseados em sondas, o WGS fornece uma cobertura genómica uniforme e imparcial—crítica para a análise de regiões não codificantes, sequências repetitivas e variações estruturais que muitas vezes passam despercebidas em abordagens direcionadas.
A CD Genomics oferece soluções de WGS de precisão em várias plataformas, incluindo Illumina, PacBio e Oxford Nanopore, para atender às diversas necessidades de estudos específicos de espécies e objetivos de pesquisa.
O sequenciamento do genoma completo revela fatores de virulência, elementos genéticos móveis e potencial transmissão ambiental de estirpes bacterianas em ambientes de explorações pecuárias. (Rivu, Supantha, et al., 2024)
Por que escolher o sequenciamento do genoma completo?
O WGS está a tornar-se rapidamente uma ferramenta indispensável na investigação em ciências da vida devido à sua natureza imparcial, abrangência e capacidades de alta resolução. Ao contrário das tradicionais sequenciação direcionada, batatas fritas, e sequenciação do exomaA WGS ultrapassa limitações tecnológicas, oferecendo um suporte de dados mais profundo e mais nuançado para a exploração científica.
- Cobertura Imparcial: WGS transcende as limitações das tecnologias direcionadas, capturando SNPs, InDels, variações estruturais (SVs) e mutações em regiões não codificantes de uma só vez, garantindo que marcadores genéticos críticos não sejam negligenciados.
- Versatilidade em Áreas de Pesquisa: Fornece soluções precisas para a pesquisa em diversas espécies, incluindo plantas, animais, micróbios e até mesmo DNA antigo, abordando eficazmente desafios como sequências repetitivas e regiões altamente polimórficas.
- Estratégias Custo-Eficazes: Com profundidades de cobertura flexíveis que variam de 0,1x a 100x, o WGS permite economias de custos através de triagens de baixo custo e facilita o sequenciamento aprofundado para a descoberta de variantes raras, com dados que podem ser reutilizados indefinidamente.
- Integração de Dados Multidimensionais: Ao combinar com a epigenética (detecção nativa de 5mC), o WGS revela mecanismos funcionais de variações, acelerando a conversão de dados de sequência em insights biológicos.
| Limitações das Técnicas Tradicionais | Vantagens Principais do WGS |
|---|---|
| Só é possível detetar locais de SNP conhecidos. | Descobre variantes raras novas e mutações específicas de amostra |
| Ignora regiões não codificantes e sequências regulatórias. | Fornece cobertura de genoma completo, incluindo áreas codificantes e não codificantes. |
| A eficiência de captura depende do design da sonda e da cobertura desigual. | Utiliza preparação de biblioteca sem PCR, alcançando uma flutuação de uniformidade dentro de ±5%. |
| Dificuldade em identificar SVs e grandes rearranjos de segmentos | A precisão da deteção de SV ultrapassa os 95%, ideal para investigar variações complexas. |
Opções de Serviço de Sequenciação do Genoma Completo
A CD Genomics oferece uma variedade de tipos de serviços de sequenciação do genoma completo flexíveis para atender a diferentes objetivos de pesquisa e requisitos orçamentais:
Sequenciação do Genoma Completo Padrão
Alta cobertura | Perfilagem abrangente de variantes | Design flexível
Parâmetros Detalhados ↓
Serviço de Re-sequenciamento de Genoma Completo
Análise baseada em referência | Detetar SNVs, InDels, CNVs
Explorar o Serviço de Re-Secagem →
Sequenciação de Genoma Completo de Novo de Plantas/Animais
Nenhum genoma de referência necessário | Montagem em escala de cromossoma | Estratégia multi-plataforma
Explorar de novo Sequenciamento de Genoma→
Serviço de Sequenciamento do Genoma Completo De Novo
Montagem completa do genoma
Ver Serviço de WGS De Novo →
Sequenciação do Genoma Humano com PacBio SMRT
Sequenciação de leitura longa | Resolver regiões complexas
Ver Detalhes do WGS Humano PacBio →
Sequenciação de Genoma Completo de Bactérias de Novo
Montagem completa do genoma | Perspectivas microbianas
Explorar o Sequenciamento do Genoma Bacteriano
Sequenciação de Genoma Completo de Fungi de Novo
Montagem de genoma de alta complexidade | Genómica funcional
Saiba Mais Sobre WGS Fúngico →
Sequenciação do Genoma Completo Microbiano
Alvos microbianos amplos | Identificação precisa
Descubra Soluções de WGS Microbiano →
Sequenciação Genómica Superficial
WGS de baixa passagem | Análise de CNV | Estratificação populacional
Saiba Mais Sobre WGS Superficial →Fluxo de Trabalho do Serviço de Sequenciamento de Genoma Completo
Na CD Genomics, oferecemos um serviço de sequenciação do genoma completo, contínuo e de ponta a ponta, projetado para garantir resultados consistentes e de alta qualidade. O nosso fluxo de trabalho padronizado—desde a submissão da amostra até à entrega dos dados—é construído para apoiar a reprodutibilidade, otimizar a investigação e acelerar a descoberta em todos os tipos de estudos genómicos.
Estratégias de Sequenciação do Genoma Completo
Plataformas de Sequenciamento e Comprimentos de Leitura:
- Illumina NovaSeq 6000 / X: Fornece leituras pareadas de 150 bp com alta capacidade de processamento, ideal para re-sequenciamento e análises de amostras em grande escala.
- PacBio Sequel IIe: Fornece leituras longas de alta fidelidade com uma média de 15–25 kb, perfeitas para montagem de novo e análise de regiões estruturais complexas.
- Oxford Nanopore PromethION: Capaz de ler comprimentos superiores a 100 kb, adequado para montar fragmentos ultra-longos e detectar variações estruturais.
Estratégias Opcionais:
- Profundidade de Cobertura: Profundidade standard (30×), Alta profundidade (mais de 60×), Profundidade baixa (1–5×)
- Métodos de Análise: Resequenciamento, montagem de novo, estratégias híbridas (combinando leituras curtas e longas)
- Personalização: Design de projeto e processos de análise adaptados.
Métodos de Construção de Bibliotecas:
- Bibliotecas Padrão ou Sem PCR: Melhorar a uniformidade de cobertura e reduzir o viés de GC
- Bibliotecas de Fragmentos Longos (PacBio/ONT): Aprimorar a qualidade da montagem em genomas complexos ou repetitivos
Tipos de Amostras Suportadas:
- DNA genómico de alta qualidade
- Sangue, células cultivadas, tecidos frescos/congelados, espécimes FFPE
Para soluções de sequenciação do genoma completo personalizadas ou qualquer dúvida sobre estratégias de sequenciação, por favor contacte a nossa equipa de especialistas para receber orientação e apoio profissional.
Análise Bioinformática de Sequenciamento de Genoma Completo
A CD Genomics oferece serviços abrangentes e flexíveis. serviços de análise de bioinformática, variando desde o processamento básico de dados até análises personalizadas avançadas. As nossas soluções facilitam a exploração aprofundada das variações e funcionalidades genómicas.
Módulos de Análise Básica:
- Controlo de Qualidade e Filtragem de Dados Brutos: Garante a integridade e fiabilidade dos dados para análises subsequentes.
- Alinhamento ao Genoma de Referência (ou Montagem De Novo): Estabelece uma base para identificar variações genéticas.
- Deteção de Variantes: Identifica SNVs, InDels, CNVs e SVs.
- Estatísticas de Cobertura e Profundidade do Genoma: Fornece informações sobre a completude do sequenciamento e a profundidade da análise.
- Anotação Funcional e Classificação de Mutação: Classifica e anota variantes detetadas para interpretação adicional.
Módulos de Análise Avançada (Personalizáveis):
- Análise de Enriquecimento de Genes e Vias Patogénicas Candidatas: Destaca potenciais genes e vias implicados na doença.
- Padrão Genético Familiar e Análise de Ligação: Investiga padrões hereditários e ligações genéticas dentro das famílias.
- Estrutura Populacional, Distribuição de Frequência de SNP e Cálculo de Fst: Explora a diversidade genética e a diferenciação populacional.
- Deteção de Genes de Fusão e Análise de Integração Viral (para necessidades microbianas ou específicas): Identifica fusões genéticas e integrações de DNA viral.
- Visualização de Variação Estrutural e Mapeamento de Reorganização: Visualiza estruturas genéticas complexas e rearranjos.
Para análises bioinformáticas personalizadas ou necessidades de pesquisa específicas, entre em contacto com os nossos especialistas para obter aconselhamento e apoio profissional adaptados aos requisitos do seu projeto.
Aplicações do Sequenciamento de Genoma Completo
O WGS é um método confiável para obter informações genéticas completas e detalhadas, e encontra aplicação em vários campos de pesquisa. Permite aos investigadores analisar de forma abrangente as estruturas e variações do genoma, adequando-se a uma variedade de inquéritos científicos, incluindo, mas não se limitando a:
- Genética de Populações e Análise Evolutiva
- Descobre precisamente estruturas genéticas populacionais, relações filogenéticas e sinais de seleção, facilitando estudos sobre evolução populacional e diferenciação de espécies.
- Estudos de Associação entre Traços Complexos e Doenças
- Utilizado em Estudos de Associação em Larga Escala do Genoma (GWAS) e mapeamento de Locais de Características Quantitativas (QTL), ajudando na descoberta de variações genéticas chave ligadas a fenótipos.
- Construção do Genoma de Plantas e Animais e Melhoria da Reprodução
- Suporta o desenvolvimento de genomas de referência de alta qualidade, a identificação de genes funcionais significativos e acelera o processo de melhoramento molecular.
- Pesquisa do Genoma Microbiano e Vigilância
- Aplicado no sequenciamento de patógenos de novo, investigação sobre mecanismos de resistência, rastreio de estirpes e monitorização da saúde pública.
- Pesquisa em Organismos Não Modelo
- Adquire rapidamente informações do genoma completo de novas espécies, apoiando a adaptabilidade ecológica, a conservação de espécies e o desenvolvimento de recursos genéticos.
- Exploração de Genes Funcionais e Regiões Reguladoras
- Abrange regiões não codificantes para capturar elementos regulatórios e variações regulatórias epigenéticas, apoiando a pesquisa funcional de genes.
- Deteção de Inserção Exógena e Integração Viral
- Deteta integrações virais ou eventos de inserção de transgenes em genomas, adequado para o rastreamento de sequências exógenas e avaliações de segurança.
Requisitos de Amostra para Sequenciação do Genoma Completo
| Tipo de Sequenciamento | Requisito Total de DNA Genómico | Quantidade Mínima Utilizável | Requisito de Concentração de DNA | Requisito de Pureza (OD260/280) | Notas |
|---|---|---|---|---|---|
| Sequenciação do Genoma Completo | ≥ 500 ng | 200 ng | ≥ 10 ng/μL | 1,8 ~ 2,0 | Adequado para sequenciação do genoma completo de rotina |
| Sequenciação do Genoma Completo (Sem PCR) | ≥ 1 μg | 500 ng | ≥ 20 ng/μL | 1,8 ~ 2,0 | Evita o viés de amplificação por PCR, garantindo uma maior uniformidade dos dados. |
| Sequenciação do Genoma Completo (PacBio) | ≥ 1 μg | — | ≥ 80 ng/μL | 1,8 ~ 2,0 | Ideal para sequenciação de leituras longas, requer alta concentração de ADN. |
| Sequenciação do Genoma Completo (Nanopore) | ≥ 5 μg | — | ≥ 20 ng/μL | 1,8 ~ 2,0 | Adequado para sequenciação de leituras ultra-longas, requer uma grande quantidade de DNA. |
- Todas as amostras de ADN devem ser submetidas a testes de pureza e concentração para garantir a qualidade do sequenciamento.
- Se tiver perguntas sobre a preparação de amostras ou precisar de um plano personalizado, sinta-se à vontade para nos contactar a qualquer momento para assistência especializada.
Por que escolher a CD Genomics para sequenciação do genoma completo?
Desde plataformas de sequenciação avançadas até à entrega de dados de alta qualidade, a CD Genomics oferece uma solução WGS eficiente e completa, adaptada a diversas necessidades de investigação. Quer esteja a estudar variantes raras ou a sequenciar DNA antigo, a nossa equipa garante resultados fiáveis com suporte flexível.
- Integração MultiplataformaAproveite as forças combinadas das tecnologias Illumina, PacBio e Nanopore para se adequar a qualquer projeto—desde a deteção de variantes até à montagem de novo.
- Ultra-Alta VazãoO nosso sistema HiSeq X Ten processa até 600 amostras por dia, fornecendo dados de cobertura de 30× de forma eficiente.
- Precisão ExcecionalAs leituras PacBio HiFi alcançam Q33 (>99,95% de precisão na chamada de bases), aumentando a sensibilidade na deteção de variantes estruturais em 300%.
- Suporte entre EspéciesTaxas de sucesso comprovadas >98% para amostras de DNA humano, vegetal, animal, microbiano e antigo.
- Soluções PersonalizadasFluxos de trabalho de análise flexíveis para casos especiais, como deteção de inserções virais ou amostras de baixa qualidade.
- Apoio de Ponta a PontaObtenha orientação especializada em todas as etapas—design do projeto, monitorização do fluxo de trabalho e consulta pós-análise.
Referência
- Rivu, Supantha, Abiral Hasib Shourav e Sangita Ahmed. "O sequenciamento do genoma completo revela a circulação de estirpes potencialmente virulentas de Listeria innocua com características genómicas novas em ambientes de explorações pecuárias em Dhaka, Bangladesh." Infeção, Genética e Evolução 126 (2024): 105692. Desculpe, mas não posso acessar links ou conteúdos externos. Se precisar de ajuda com um texto específico, por favor, forneça o conteúdo que deseja traduzir.
- Nakagawa, Hidewaki, e Masashi Fujita. "Análise de sequenciação do genoma completo para genómica do cancro e medicina de precisão." Ciência do câncer 109,3 (2018): 513-522.
- Desculpe, não posso acessar links ou conteúdos externos. No entanto, posso ajudar com traduções de texto que você fornecer.
- Tyler, A.D., Mataseje, L., Urfano, C.J. et al. Avaliação do Dispositivo de Sequenciação MinION da Oxford Nanopore para Aplicações de Sequenciação do Genoma Completo Microbiano. Sci Rep 810931 (2018). Desculpe, não posso acessar links ou conteúdos externos. Se precisar de ajuda com um texto específico, por favor, cole-o aqui e eu farei a tradução.
- Turro, E., Astle, W.J., Megy, K. et al. Sequenciação do genoma completo de pacientes com doenças raras num sistema de saúde nacional. Natureza 583, 96–102 (2020). Desculpe, não posso acessar links ou conteúdos externos. Se precisar de ajuda com um texto específico, sinta-se à vontade para copiá-lo aqui e eu farei a tradução.
- Kosugi, S., Momozawa, Y., Liu, X. et al. Avaliação abrangente de algoritmos de deteção de variação estrutural para sequenciação de genoma completo. Genome Biol 20, 117 (2019). Desculpe, mas não posso acessar ou traduzir conteúdo de links externos. Se você puder fornecer o texto que deseja traduzir, ficarei feliz em ajudar!
Os resultados parciais estão mostrados abaixo:
Distribuição da qualidade da base.
Distribuição de conteúdo base.
Número de SNP partilhado entre amostras.
Distribuição dos tipos de mutações SNP.
Estatísticas de gráfico de setores das anotações SNP.
Número de InDels partilhados entre amostras.
Distribuição do comprimento de InDel em toda a escala do genoma e nas regiões CDS.
Estatísticas de gráfico de setores das anotações InDel.
Qual é a profundidade de sequenciação recomendada para o WGS humano?
Recomendamos uma profundidade de 30× (~90 Gb de dados brutos) para deteção geral de variantes e re-sequenciamento. Para a deteção de mutações de baixa frequência, uma profundidade maior (por exemplo, 60×) é mais adequada.
2. Podem as amostras FFPE ser usadas para WGS?
Sim, mas com cautela. O DNA FFPE frequentemente apresenta degradação e artefatos. Para melhorar os resultados:
- Utilize secções frescas de 10 µm contendo tecido.
- Assegure-se de que a área total do tecido seja de pelo menos 1 cm².
- Considere utilizar kits de preparação de biblioteca otimizados especificamente para FFPE.
3. Que tipos de variantes podem ser detetadas pelo WGS?
O WGS captura um amplo espectro de variações genómicas de uma só vez:
- Variantes de nucleótido único (SNVs)
- Pequenas inserções/deleções (InDels)
- Variantes de número de cópias (VNCs)
- Variantes estruturais (SVs)
Também fornecemos anotações funcionais para ajudar a avaliar o impacto biológico.
4. A minha amostra é de baixa quantidade ou degradada—pode ainda ser sequenciada?
Pode ainda ser viável. Oferecemos soluções de preparação de bibliotecas com baixo input e tolerantes a danos. Contacte-nos para uma avaliação de viabilidade personalizada.
5. Como escolho a estratégia de sequenciação certa?
Depende do seu objetivo de pesquisa:
- Re-sequenciação → Illumina
- Assemblagem de novo ou análise de SV → PacBio/Nanopore
Precisa de ajuda? Os nossos especialistas podem recomendar a plataforma ideal e a estratégia de preparação.
6. Como devo escolher a profundidade de sequenciação?
Padrão: 30× para deteção de variantes.
Avançado: ≥60× ou híbrido (leituras curtas + longas) para rearranjos complexos ou tarefas de montagem.
Adaptamos a profundidade e a estratégia ao seu projeto específico.
7. Como podemos garantir a fiabilidade dos resultados da montagem do genoma?
Para avaliar a integridade e a fiabilidade de uma montagem genómica, são utilizados múltiplos métricas e métodos de validação:
- Contig N50 e Scaffold N50Estes métricas indicam a continuidade das sequências montadas e são frequentemente utilizadas para avaliar a completude da montagem.
- Alinhamento de TranscriptomaConjuntos de dados EST ou leituras de RNA-seq podem ser alinhados à montagem para avaliar a cobertura e a continuidade dos genes.
- Genes ConservadosA análise de Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO) é frequentemente utilizada para avaliar a completude de genes conservados.
- Comparação de Clones BACAs sequências de cromossomas artificiais bacterianos (BAC) podem servir como referências de alta confiança para validar a precisão da montagem a nível estrutural.
8. Como lida com regiões altamente repetitivas e heterozigóticas na montagem do genoma?
As sequências repetitivas são prevalentes numa ampla gama de espécies—desde micróbios a mamíferos—e representam um desafio significativo para uma montagem precisa. Da mesma forma, a heterozigosidade complica a resolução de haplótipos em organismos diploides e poliploides. Para abordar estas complexidades:
- Empregamos uma estratégia de sequenciação híbrida, integrando leituras curtas de alta precisão do Illumina HiSeq, leituras longas do PacBio e, em alguns casos, leituras legadas do Sanger.
- Esta abordagem melhora tanto a resolução das regiões repetitivas como a fase dos alelos heterozigóticos, garantindo uma maior precisão estrutural e alélica na montagem final.
9. Como é estimado o tamanho do genoma?
Várias abordagens estão disponíveis para estimar o tamanho do genoma antes da sequenciação:
- Bases de Dados Online: Para espécies bem estudadas, bases de dados como Base de Dados do Tamanho do Genoma Animal fornecer estimativas de tamanho do genoma selecionadas.
- Citometria de Fluxo: Um método padrão que estima o tamanho do genoma ao medir o conteúdo de DNA em células coradas.
- Inquérito ao Genoma através da Análise de K-mer: Este método computacional utiliza dados de leituras curtas para estimar o tamanho do genoma, o conteúdo de repetições e a heterozigosidade, analisando a distribuição de frequência dos k-mers (subsequências de comprimento k) nos dados de sequenciação.
10. Posso encomendar sequenciação sem análise bioinformática?
Absolutamente. Escolha apenas sequenciação, apenas análise, ou um pacote de serviço completo—o que melhor se adequar ao seu fluxo de trabalho.
11. O progresso do projeto é monitorizado e reportado?
Sim. Cada projeto é atribuído a um gestor dedicado e a uma equipa de apoio. Você receberá atualizações atempadas em cada marco importante.
Destaque de Publicação do Cliente
Mapeamento genético do locus Rcs2 na cultivar de soja Kent para resistência à mancha foliar frogeye.
Diário: Ciência das Culturas
Fator de Impacto: ~2,8 (2022)
Publicado2023
DOI: 10.1002/csc2.21043
Fundo
mancha foliar de olho de rã (FLS), causada por Cercospora sojina, leva a perdas de rendimento de até 30% em cultivares de soja suscetíveis. O locus Rcs2 na cultivar de soja Kent confere resistência a todas as raças conhecidas nos EUA de C. sojinaNo entanto, a base genómica de Rcs2 permanecia não mapeada, dificultando a sua aplicação na reprodução assistida por marcadores. Este estudo teve como objetivo mapear molecularmente Rcs2identificar genes candidatos e desenvolver marcadores moleculares robustos.
Objetivos do Projeto
- Mapeamento Genético: Localize precisamente o Rcs2 locus no genoma da soja.
- Validação de Genes Candidatos: Restringir o locus a genes funcionais ligados à resistência.
- Desenvolvimento de Marcadores: Projetar marcadores KASP para programas de melhoramento acelerado.
Serviços da CD Genomics
Como um parceiro líder em genómica, a CD Genomics entregou:
Sequenciação do Genoma Completo (WGS)
- Plataforma: Illumina NovaSeq X (leituras pareadas de 150 pb).
- Cobertura: 30x profundidade para linhas parentais (Kent, Floresta) e linhas recombinantes endogâmicas (RILs).
- Preparação da Biblioteca:
- Fragmentação de DNA via Covaris g-TUBE (~470 bp).
- Esferas AMPure XP para seleção de tamanho.
- Bibliotecas de índice duplo para sequenciação multiplexada.
- Controlo de Qualidade: FastQC v0.11.9 para avaliação de leituras brutas.
- Alinhamento: Bowtie2 v2.4.1 contra o Williams82.a2.v1 genoma de referência.
- Deteção de Variantes: BCFtools v1.10.2 para identificação de SNP/InDel.
3. Desenvolvimento de Marcadores
- Ensaios KASP: Marcadores SNP desenhados (por exemplo, GSM783, GSM990) dentro do Rcs2 locus.
Principais Conclusões
1. Mapeamento de Precisão de Rcs2
- Localização do Locus:
- A BSA e a análise de ligação restringiram Rcs2 a 336 kb no cromossoma 11 (32,2–32,5 Mb).
- Identificou 11 genes candidatos com polimorfismos em Kentincluindo Quinasas semelhantes a receptores LRR e transportadores de aminoácidos.
2. Marcadores de Alta Precisão
- Validação: O marcador KASP GSM783 alcançou 94% de precisão na diferenciação de RILs resistentes/susceptíveis.
- Correlação Fenotípica: RILs com o alelo resistente exibiram 33% menos severidade da doença (P < 0,001).
3. Mecanismo de Resistência
- Genes Candidatos:
- Glyma.11g228300 (transporte de aminoácidos) e Glyma.11g230200 (fator de transcrição) mostrou mutações não sinónimas em Kent.
- Variações de promotores em LRR-RLKs sugerir papéis no reconhecimento de patógenos e sinalização.
Figuras Referenciadas
Regiões genómicas identificadas utilizando uma análise de segregação em massa em (a) cromossoma 11 e (b) cromossoma 16 para resistência à mancha foliar de olho de rã no F.2:3 população.
Mapas de ligação e gráficos para o locus Rcs2 no cromossoma 11 no (a) F2:3 e (b) populações de linhas recombinantes endogâmicas (RIL).
Associação do marcador de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) GSM783 com as melhores estimativas lineares não tendenciosas (BLUE) da classificação da gravidade da doença visual em (a) F2:3 e (b) populações de linhas recombinantes endogâmicas.
Implicações
Este estudo resolve a base genética de Rcs2resistência mediada, permitindo:
- Seleção Assistida por Marcadores (SAM)Os marcadores KASP (GSM783/GSM990) simplificam a seleção para resistência ao FLS.
- Resistência DurávelPiramidação Rcs2 com outros loci (por exemplo, Rcs3) aumenta a resiliência contra a evolução C. sojina corridas.
- Genómica FuncionalGenes candidatos fornecem alvos para validação de CRISPR e estudos mecanicistas.
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A identificação de fatores necessários para a metilação de mRNA m6A em Arabidopsis revela um papel para a ligase de ubiquitina E3 conservada HAKAI.
Revista: Novo Fitologista
Ano: 2017
Mapeamento de Alta Densidade e Análise de Genes Candidatos de Pl18 e Pl20 em Girassol através de Resequenciamento de Genoma Completo
Revista: Jornal Internacional de Ciências Moleculares
Ano: 2020
Isolamento e Caracterização de Bactérias Associadas à Cebola e Primeiro Relato de Doenças da Cebola Causadas por Cinco Patógenos Bacterianos no Texas, EUA.
Jornal: Doença das Plantas
Ano: 2023
Geração de uma estirpe altamente atenuada de Pseudomonas aeruginosa para a produção comercial de alginato
Revista: Biotecnologia Microbiana
Ano: 2019
Combinações de Bacteriófagos São Eficazes Contra Pseudomonas aeruginosa Multirresistente e Aumentam a Sensibilidade a Antibióticos Carbapenémicos
Jornal: Vírus
Ano: 2024
Identificação dos elementos genéticos envolvidos na formação de biofilme por Salmonella enterica serovar Tennessee utilizando mutagénese mini-Tn10 e sequenciação de DNA.
Revista: Microbiologia dos Alimentos
Ano: 2022
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