Em 2017, a Illumina anunciou novos sequenciadores, NovaSeq 6000, que poderiam potencialmente reduzir o custo do sequenciamento do genoma humano para 100 dólares no futuro. O NovaSeq é montado com um novo conjunto de células de fluxo: S1, S2, S3 e S4. Ambos os sistemas podem funcionar com uma ou duas células de fluxo. Além disso, o NovaSeq 6000 pode realizar leituras de 2×50 bp, 2×100 bp e 2×150 bp utilizando as células de fluxo S1 e S2, bastante semelhante às máquinas Illumina existentes.
O Sistema NovaSeq 6000 inaugura uma nova era em sequenciação com inovações revolucionárias, proporcionando aos utilizadores a capacidade de processamento, velocidade e flexibilidade para concluir projetos de forma mais rápida e económica do que nunca, sendo construído desde o início, oferece escalabilidade e flexibilidade para qualquer tipo de sequenciação, seja em grande escala ou sequenciação direcionada.
A série NovaSeq permite levar a sua investigação mais longe com uma ampla gama de tamanhos de projetos para diversas aplicações—tudo num único sistema. Esta plataforma redefine sequenciação de alto rendimento com um rendimento inigualável, facilidade de uso, baixos custos por amostra e flexibilidade sem igual. Quer esteja interessado em aplicações de maior rendimento para projetos de maior escala ou em aplicações de menor rendimento para projetos de menor escala, a Série NovaSeq irá capacitá-lo com novas possibilidades. Assista genoma completo e sequenciação do exoma completo demonstrações e aprenda como a série NovaSeq pode satisfazer as necessidades em evolução do seu laboratório.
Destaques do NovaSeq 6000:
Parâmetros de Desempenho do NovaSeq 6000
| Tipo de célula de fluxo | SP | S1 | S2 | S4 |
|---|---|---|---|---|
| Faixas por célula de fluxo | 2 | 2 | 2 | 2 |
| Saída por célula de fluxo | ||||
| 2×50 pb | 65-80 Gb | 134-167 Gb | 333-417 Gb | N/A |
| 2×100 pb | N/A | 266-333 Gb | 667-833 Gb | 1600-2000 Gb |
| 2×150 pb | 200-250 Gb | 400-500 Gb | 1000-1250 Gb | 2400-3000 Gb |
| Leituras únicas | 0,65-0,8 B | 1,3-1,6 B | 3,3-4,1 B | 8-10 B |
| Leituras em pares | 1,3-1,6 B | 2,6-3,2 B | 6,6-8,2 B | 16-20 B |
| Pontuações de qualidade | ||||
| 2×50 pb | ≥ 85% | |||
| 2×100 pb | ≥ 80% | |||
| 2×150 pb | ≥ 75% | |||
| Tempo de execução | ||||
| 2×50 pb | ~13 h | ~13 h | ~16 h | N/A |
| 2×100 pb | N/A | ~19 h | ~25 h | ~36 h |
| 2×150 pb | ~25 h | ~25 h | ~36 h | ~44 h |
Fluxo de trabalho do NovaSeq 6000:
O procedimento operacional padrão no sistema NovaSeq 6000 abrange várias etapas imperativas:
Aplicações do NovaSeq 6000:
A adaptabilidade do sistema NovaSeq 6000 permite uma ampla gama de aplicações, abrangendo:
Análise Comparativa do NovaSeq 6000 e Outros Sistemas de Sequenciação
| Recurso | NovaSeq 6000 | HiSeq 2500 | MiSeq | NextSeq 500 |
|---|---|---|---|---|
| Rendimento | Ultra-alto (até 3 Tb) | Alto (até 1 Tb) | Baixo (até 15 Gb) | Médio-alto (até 120 Gb) |
| Comprimento de Leitura | 50pb a 300pb | 50pb a 250pb | 50pb a 600pb | 75pb a 150pb |
| Tempo de Execução | Curto (<48 horas) | Longo (36 horas a 11 dias) | Curto (4 a 55 horas) | Médio (~29 horas) |
| Aplicações | Genómica, transcriptómicapesquisa sobre o câncer | Genómica, transcriptómica, investigação do câncer | Genomas pequenos, sequenciação de rRNA 16S, sequenciação direcionada | Genómica, transcriptómica, sequenciação direcionada |
| Vazão de Amostra | Alto (múltiplas amostras por corrida) | Médio (múltiplas amostras por corrida) | Baixo (adequado para algumas amostras) | Médio-alto (múltiplas amostras por corrida) |
| Custo do Instrumento | Alto | Alto | Baixo | Médio-alto |
| Custo de Funcionamento | Alto | Alto | Baixo | Médio |
| Qualidade dos Dados | Alto (alta precisão e consistência) | Alto (alta precisão e consistência) | Alto (alta precisão) | Alto (alta precisão e consistência) |
Notas:
Rendimento: A quantidade de dados gerados por corrida de sequenciação.
Comprimento da Leitura: O número de pares de bases lidos por cada leitura de sequenciação.
Tempo de Execução: O tempo necessário para completar uma corrida de sequenciação.
Aplicações: Os campos e usos para os quais o sistema é adequado.
Taxa de Amostragem: O número de amostras que podem ser processadas por execução.
Custo do Instrumento: O custo de aquisição e manutenção do instrumento de sequenciação.
Custo de Execução: O custo por corrida de sequenciação, incluindo reagentes e consumíveis.