NovaSeq 6000

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Em 2017, a Illumina anunciou novos sequenciadores, NovaSeq 6000, que poderiam potencialmente reduzir o custo do sequenciamento do genoma humano para 100 dólares no futuro. O NovaSeq é montado com um novo conjunto de células de fluxo: S1, S2, S3 e S4. Ambos os sistemas podem funcionar com uma ou duas células de fluxo. Além disso, o NovaSeq 6000 pode realizar leituras de 2×50 bp, 2×100 bp e 2×150 bp utilizando as células de fluxo S1 e S2, bastante semelhante às máquinas Illumina existentes.

O Sistema NovaSeq 6000 inaugura uma nova era em sequenciação com inovações revolucionárias, proporcionando aos utilizadores a capacidade de processamento, velocidade e flexibilidade para concluir projetos de forma mais rápida e económica do que nunca, sendo construído desde o início, oferece escalabilidade e flexibilidade para qualquer tipo de sequenciação, seja em grande escala ou sequenciação direcionada.

A série NovaSeq permite levar a sua investigação mais longe com uma ampla gama de tamanhos de projetos para diversas aplicações—tudo num único sistema. Esta plataforma redefine sequenciação de alto rendimento com um rendimento inigualável, facilidade de uso, baixos custos por amostra e flexibilidade sem igual. Quer esteja interessado em aplicações de maior rendimento para projetos de maior escala ou em aplicações de menor rendimento para projetos de menor escala, a Série NovaSeq irá capacitá-lo com novas possibilidades. Assista genoma completo e sequenciação do exoma completo demonstrações e aprenda como a série NovaSeq pode satisfazer as necessidades em evolução do seu laboratório.

Destaques do NovaSeq 6000:

  • Throughput escalável. O sistema NovaSeq 6000 oferece sequenciação de alto rendimento num amplo leque de aplicações. Satisfaça as suas necessidades de investigação com um rendimento sem precedentes ao menor custo por amostra.
  • Altamente Flexível. Ajuste a saída de dados às necessidades do projeto. Com a capacidade de escolher entre 4 tipos diferentes de células de fluxo, a saída pode ser configurada para corresponder à sua aplicação e projeto. Uma ou duas células de fluxo operadas de forma independente podem ser facilmente colocadas no lugar para se adequar às suas necessidades em evolução.
  • Tecnologia madura: A série NovaSeq epitomiza a poderosa, simplificada e escalável Illumina. sequenciação de alto rendimento plataforma, tendo como pedra angular a comprovada tecnologia SBS da Illumina. Este método, baseado em terminadores reversíveis, permite o sequenciamento massivo e paralelo de bilhões de fragmentos de DNA, detectando-os à medida que bases individuais são incorporadas em cadeias de DNA em crescimento. Ao reduzir os erros causados por repetições de nucleotídeos (homopolímeros) e falhas de deteção, esta abordagem garante resultados de sequenciamento robustos e precisos.
  • Uma ampla gama de aplicações. O sequenciamento de alta qualidade e alta cobertura oferece uma visão abrangente do genoma para detectar variantes com precisão, caracterizar isoformas e muito mais. O Sistema NovaSeq 6000 permite que você adapte a corrida para atender às necessidades específicas do seu estudo. Seja explorando o genoma, epigenoma ou transcriptoma, as possibilidades para a sua pesquisa são infinitas.

Parâmetros de Desempenho do NovaSeq 6000

Tipo de célula de fluxo SP S1 S2 S4
Faixas por célula de fluxo 2 2 2 2
Saída por célula de fluxo
2×50 pb 65-80 Gb 134-167 Gb 333-417 Gb N/A
2×100 pb N/A 266-333 Gb 667-833 Gb 1600-2000 Gb
2×150 pb 200-250 Gb 400-500 Gb 1000-1250 Gb 2400-3000 Gb
Leituras únicas 0,65-0,8 B 1,3-1,6 B 3,3-4,1 B 8-10 B
Leituras em pares 1,3-1,6 B 2,6-3,2 B 6,6-8,2 B 16-20 B
Pontuações de qualidade
2×50 pb ≥ 85%
2×100 pb ≥ 80%
2×150 pb ≥ 75%
Tempo de execução
2×50 pb ~13 h ~13 h ~16 h N/A
2×100 pb N/A ~19 h ~25 h ~36 h
2×150 pb ~25 h ~25 h ~36 h ~44 h

Fluxo de trabalho do NovaSeq 6000:

O procedimento operacional padrão no sistema NovaSeq 6000 abrange várias etapas imperativas:

  • Preparação da Biblioteca: Começando com espécimes de DNA ou RNA, esta fase envolve a fragmentação do material genético, a ligação de adaptadores e a realização de amplificação.
  • Geração de Clusters: As bibliotecas são introduzidas na célula de fluxo, catalisando o surgimento de conglomerados de fragmentos de DNA clonais através de técnicas de amplificação em ponte.
  • Sequenciação: A célula de fluxo está integrada no sistema NovaSeq 6000, onde a ótica de ponta e as químicas de sequenciação aceleradas capturam a informação genómica.
  • Análise de Dados: A saída de sequenciação é sujeita a análise utilizando o conjunto de recursos bioinformáticos da Illumina, facilitando operações simplificadas como alinhamento, identificação de variantes e interpretação subsequente dos dados.

Aplicações do NovaSeq 6000:

A adaptabilidade do sistema NovaSeq 6000 permite uma ampla gama de aplicações, abrangendo:

Análise Comparativa do NovaSeq 6000 e Outros Sistemas de Sequenciação

Recurso NovaSeq 6000 HiSeq 2500 MiSeq NextSeq 500
Rendimento Ultra-alto (até 3 Tb) Alto (até 1 Tb) Baixo (até 15 Gb) Médio-alto (até 120 Gb)
Comprimento de Leitura 50pb a 300pb 50pb a 250pb 50pb a 600pb 75pb a 150pb
Tempo de Execução Curto (<48 horas) Longo (36 horas a 11 dias) Curto (4 a 55 horas) Médio (~29 horas)
Aplicações Genómica, transcriptómicapesquisa sobre o câncer Genómica, transcriptómica, investigação do câncer Genomas pequenos, sequenciação de rRNA 16S, sequenciação direcionada Genómica, transcriptómica, sequenciação direcionada
Vazão de Amostra Alto (múltiplas amostras por corrida) Médio (múltiplas amostras por corrida) Baixo (adequado para algumas amostras) Médio-alto (múltiplas amostras por corrida)
Custo do Instrumento Alto Alto Baixo Médio-alto
Custo de Funcionamento Alto Alto Baixo Médio
Qualidade dos Dados Alto (alta precisão e consistência) Alto (alta precisão e consistência) Alto (alta precisão) Alto (alta precisão e consistência)

Notas:
Rendimento: A quantidade de dados gerados por corrida de sequenciação.
Comprimento da Leitura: O número de pares de bases lidos por cada leitura de sequenciação.
Tempo de Execução: O tempo necessário para completar uma corrida de sequenciação.
Aplicações: Os campos e usos para os quais o sistema é adequado.
Taxa de Amostragem: O número de amostras que podem ser processadas por execução.
Custo do Instrumento: O custo de aquisição e manutenção do instrumento de sequenciação.
Custo de Execução: O custo por corrida de sequenciação, incluindo reagentes e consumíveis.

Apenas para fins de investigação, não se destina a diagnóstico clínico, tratamento ou avaliações de saúde individuais.
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