Sequenciação de DNA 6mA

Como experientes fornecedores de Sequenciação de Nova Geração (NGS) e serviços de sequenciação de terceira geração, o nosso compromisso reside em fornecer quantidades incomparáveis de dados de sequenciação para apoiar metodologias analíticas rápidas e inovadoras, tudo enquanto oferecemos soluções económicas. Profundamente habilidosos no domínio da sequenciação de DNA 6mA, aproveitamos sequenciadores de alta capacidade de última geração, metodologias de sequenciação meticulosas e sofisticadas. análise bioinformática caminhos para fornecer aos nossos clientes serviços garantidos e imparciais.

A Introdução da Sequenciação de DNA 6mA

A metilação do DNA está implicada como uma marca epigenética em vários processos importantes em eucariotos. A 5-metilcitosina (5mC) é a modificação de metilação do DNA mais predominante em eucariotos e tem sido reconhecida como uma das marcas epigenéticas mais bem caracterizadas. A N6-metiladenina (6mA) foi anteriormente considerada como existindo apenas em procariotos, eucariotos unicelulares e plantas. Nos últimos anos, a 6mA no DNA foi definida como outra marca epigenética e epitranscriptómica importante em eucariotos superiores. Uma diminuição significativa nos níveis de 6mA também foi relatada em uma variedade de células cancerígenas (dados não publicados).

A CD Genomics utiliza várias estratégias para validar o estado de metilação em todo o genoma e a abundância de locais individuais de 6mA. O sequenciamento de leituras longas desenvolvido por Pacbio e o Nonapore pode ser utilizado para detectar 6mA em diferentes genomas. A imunoprecipitação de DNA 6mA seguida de sequenciação profunda (DIP-Seq) é outra ferramenta chave para identificar regiões no genoma que contêm 6mA.

Métodos de deteção de 6mA no DNA

No domínio da deteção de 6mA, várias metodologias destacam-se:

6mA-IPseq: Este método envolve a imunoprecipitação de fragmentos de DNA metilados utilizando anticorpos 6mA, seguido de sequenciação. É rentável, mas carece de uma localização precisa dos locais de metilação devido a limitações dos anticorpos e potenciais falsos positivos provenientes de DNA não metilado e interferência de RNA.

6mA-REseq: Com base na digestão de enzimas de restrição de motivos não metilados, este método avalia o estado de metilação com base na razão entre motivos internos e terminais. Está limitado por locais de restrição específicos e potenciais falsos positivos devido à digestão incompleta.

HPLC-MS/MS: A cromatografia líquida de alta performance acoplada à espectrometria de massa em tandem oferece uma sensibilidade e especificidade excecionais na identificação de 6mA. Este método permite a quantificação precisa de nucleosídeos; no entanto, é suscetível a interferências de contaminação bacteriana, exigindo controlos experimentais rigorosos.

SMRT: Sequenciação em tempo real de molécula única aproveita as ADN polimerases e os nucleótidos marcados com fluorescência para detectar diretamente as modificações de 6mA. Embora ofereça um poder considerável, é suscetível a taxas elevadas de falsos positivos, particularmente em cenários com baixas concentrações de 6mA. Além disso, carece da capacidade de diferenciar entre as modificações de 6mA e 1mA.

Modelos Preditivos de Aprendizagem Profunda: Diversos modelos de deep learning surgiram para a previsão de locais de 6mA, por exemplo, DNA6mA-MINT, i6mA-stack, Deep6mA, entre outros. Estes modelos apresentam uma precisão impressionante; no entanto, a sua aplicabilidade entre espécies pode ser limitada, necessitando de esforços contínuos de otimização.

Figura 1. Métodos de deteção de 6 mA. (A) 6 mA-IPseq e 6 mA-REseq. (B) HPLC-MS/MS. (C) SMRT. (D) Modelo preditivo de aprendizagem profunda. (Li et al., 2022)

Vantagens da Sequenciação de DNA 6mA

• Decodificação dos Padrões de Metilação do DNA Genómico: 6mA é uma modificação crucial no DNA genómico, implicada na regulação da expressão génica e na estabilidade genómica. O sequenciamento para 6mA proporciona informações sobre o seu padrão de distribuição, níveis de modificação e a sua associação com processos biológicos, avançando assim a nossa compreensão da sua função e importância.
• Cobertura de Alta Resolução e Genoma Completo: A tecnologia de sequenciação de terceira geração permite a sequenciação direta de moléculas de DNA individuais, proporcionando uma resolução superior à da sequenciação tradicional. sequenciação de segunda geraçãoConsequentemente, permite a deteção precisa da distribuição de 6mA e oferece acesso irrestrito ao longo do genoma, possibilitando a deteção de 6mA em todo o genoma.
• Alta Sensibilidade e Especificidade: A sequenciação de terceira geração apresenta uma sensibilidade e especificidade excecionais, permitindo a deteção precisa de modificações de 6mA enquanto distingue outras modificações relacionadas. Esta capacidade facilita o enriquecimento e a deteção eficientes de 6mA, promovendo assim uma compreensão mais profunda da sua função biológica e significado.
• Captura de Informação de Longa Distância: A capacidade da sequenciação de terceira geração de capturar fragmentos de DNA maiores numa única leitura melhora a nossa compreensão das interações de longa distância e dos mecanismos regulatórios do 6mA a uma escala genómica.
• Enriquecimento e Detecção Eficientes: A técnica DIP-Seq de 6mA aproveita a especificidade dos anticorpos de 6mA para enriquecer fragmentos de DNA metilados e analisá-los utilizando tecnologia de sequenciação profunda. Esta abordagem facilita o enriquecimento e a deteção eficientes de 6mA, permitindo uma determinação precisa dos seus loci e padrões de distribuição.
• Custo-Efetividade: Em comparação com outros métodos comparáveis, o 6mA DIP-Seq revela-se menos dispendioso, posicionando-o como uma escolha economicamente viável, especialmente para projetos de sequenciação de 6mA em grande escala ou aqueles com restrições orçamentais.
• Facilidade de Operação: O procedimento relativamente simplificado e direto do 6mA DIP-Seq elimina a necessidade de etapas de pré-processamento complexas, tornando-o mais acessível aos investigadores, ao mesmo tempo que garante dados de sequenciação de 6mA fiáveis num período de tempo mais curto.

Aplicação da Sequenciação de DNA 6mA

Estudos de Regulação Epigenética: A utilização da sequenciação de DNA 6mA tem-se revelado instrumental na descoberta da intrincada paisagem epigenética dos organismos. Este método avançado identifica locais de modificação 6mA em todo o genoma, um passo crucial para revelar os seus padrões de distribuição e a sua dinâmica temporal. A nossa compreensão de como as modificações 6mA servem como elementos reguladores na expressão génica, na conformação da cromatina e em mecanismos epigenéticos mais amplos é fundamental para desconstruir os sofisticados mecanismos que governam diversas atividades celulares e trajetórias de desenvolvimento.

Exploração dos Mecanismos da Doença: As perturbações nas modificações de 6mA do DNA têm sido cada vez mais implicadas na patologia de uma variedade de doenças, incluindo o câncer, disfunções neurológicas e distúrbios metabólicos. O poder do sequenciamento de 6mA do DNA reside na sua capacidade de facilitar comparações informadas entre tecidos patológicos e saudáveis, permitindo assim identificar vários padrões de modificação de 6mA que refletem os estados da doença afetada. Essas descobertas reveladoras aceleram a identificação de biomarcadores diagnósticos e possíveis alvos terapêuticos, e, em última análise, fornecem direções inovadoras para esforços adicionais de prevenção e controle de doenças.

Investigação em Biologia do Desenvolvimento: As modificações de N6-metiladenina (6mA) no DNA desempenham papéis vitais numa variedade de processos biológicos, incluindo o desenvolvimento embrionário, a diferenciação tecidual e a organogénese. A aplicação de sequenciação de DNA 6mA permite aos cientistas catalogar as mudanças dinâmicas na distribuição de 6mA ao longo de várias fases de desenvolvimento, enriquecendo assim a nossa compreensão do controlo epigenético das transições de desenvolvimento. Desvendar as interseções entre as modificações de 6mA e os perfis de expressão génica pode lançar luz sobre os mecanismos moleculares que orientam o crescimento dos organismos e eventos morfogénicos intricados.

Estudos sobre Respostas Ambientais: Os estímulos ambientais podem influenciar a paisagem das modificações de DNA 6mA, contribuindo para a resposta adaptativa de um organismo. A utilização de sequenciação de DNA 6mA permite o mapeamento das alterações no perfil de 6mA induzidas pelo ambiente, elucidando assim os papéis adaptativos destas modificações epigenéticas em resposta a perturbações ambientais. Uma compreensão aprofundada dos mecanismos moleculares que sustentam estas respostas não só expande a nossa compreensão da adaptação ambiental, mas também pode oferecer insights sobre a resiliência de diversos sistemas biológicos.

Investigação do Microbioma: As modificações de N6-metiladenina (6mA) no DNA desempenham um papel fundamental nas dinâmicas fisiológicas, patogenicidade e interações hospedeiro-microbo. O sequenciamento de DNA 6mA permite o perfilamento exaustivo dessas modificações 6mA dentro dos genomas microbianos, ajudando assim na exploração da regulação epigenética microbiana e seus efeitos consequentes no comportamento e ecologia microbiana. Ao discernir a função das modificações 6mA na adaptabilidade e patogénese microbiana, os investigadores têm o potencial de formular abordagens inovadoras para o controlo de doenças infecciosas e a manipulação de populações microbianas.

Fluxo de Trabalho de Sequenciação de DNA 6mA

A sequenciação de DNA 6mA, uma ferramenta crucial na investigação epigenética, envolve várias etapas chave para identificar e analisar com precisão as modificações N6-metiladenina (6mA) no DNA genómico. Abaixo está um fluxo de trabalho típico de sequenciação de DNA 6mA:

Especificações do Serviço

Os Nossos Métodos de Sequenciação de DNA 6mA

Sequenciação de leitura longa contribuiu significativamente para identificar a distribuição do genoma de 6mA e pode alcançar uma resolução de nucleotídeo único. Como a abundância absoluta de 6mA é relativamente baixa, é necessária uma cobertura suficiente superior a 100x. Sequenciação SMRT permite a deteção direta de nucleotídeos modificados no molde de DNA, incluindo 6mA, 5mC, e 5-hidroximetilcitosina, e não afeta negativamente a determinação da sequência primária de DNA. As modificações de base (6mA) são identificadas utilizando Análise de Modificação RS e Análise de Motivos.

Figura 2. Coleta simultânea de dados incluindo modificações de DNA.

A imunoprecipitação de DNA 6mA seguida de sequenciação profunda (6mA DIP-Seq) foi desenvolvida a partir de abordagens existentes utilizadas para detectar a metilação de adenosina em RNA. Desenvolvemos este protocolo e adaptámo-lo para a deteção de 6mA em DNA. Neste protocolo, o DNA genómico é extraído, fragmentado e, em seguida, o DNA que contém 6mA é capturado com um anticorpo que reconhece 6mA no DNA genómico. Após lavagens subsequentes, os fragmentos de DNA que não contêm 6mA são eliminados, e os fragmentos que contêm 6mA são eluídos do anticorpo para serem processados posteriormente para análises subsequentes.

Figura 3. Ilustração da imunoprecipitação de DNA a 6mA.

	Requisitos de Amostra Sequenciação de leitura longa: É necessário um mínimo de 10 μg de DNA HMW. 6mA DIP-Seq: É necessário um mínimo de 5 μg de gDNA. Valor DIN ≥ 7.0.
	Sequenciação Plataforma PacBio SMRT NovaSeq6000, PE150 20-30M leituras limpas
	Análise de Dados Fornecemos várias análises de bioinformática personalizadas: Identificação de Picos de Enriquecimento de Metilação de DNA Identificação de locais de 6mA Anotação dos Picos de Enriquecimento de Metilação de DNA Identificação e Anotação de DMRs Análise GO e de Vias de Regiões de Metilação de DNA Diferencial Visualização da Metilação do DNA … (mais sob pedido)

Pipeline de Análise

Entregáveis

• Os dados de sequenciação originais
• Resultados experimentais
• Relatório de análise de dados
• Detalhes na sequenciação de 6mA do DNA para a sua escrita (personalização)

Se tiver requisitos adicionais ou perguntas, não hesite em contactar-nos.

Referências:

1. Koziol MJ, et al. Identificação de Deoxiadenosinas Metiladas em DNA Genómico por Imunoprecipitação de DNA dA6m. Bio Protoc. 2016 Nov 5;6(21).
2. Chuan-Le Xiao, et al. Sequenciação com resolução de nucleotídeo único de N6-metil-desoxiadenosina humana revela clusters assimétricos em relação à fita associados ao SSBP1 no genoma mitocondrial. Ácidos Nucleicos Res. 14 de Dezembro de 2018;46(22):11659-11670.
3. Li H, Zhang N, Wang Y, et al. Modificação de N6-metiladenina no DNA no genoma eucariótico. Fronteiras em Genética, 2022, 13: 914404.
4. Li X, Zhang Z, Luo X, et al. A exploração da metilação de N6-desoxiadenosina em genomas de mamíferos. Proteína e célula, 2021, 12(10): 756-768.

Exemplos de gráficos de entrega parcial:

Quais são os métodos mais comumente utilizados para a deteção de 6mA no DNA?

As metodologias comumente empregues para a deteção de 6mA no DNA abrangem um espectro de técnicas, incluindo cromatografia líquida-espectrometria de massas em tandem (LC-MS/MS), ensaios dependentes de anticorpos como imunoblotting e imunofluorescência (IF), imunoprecipitação acoplada a sequenciação (DIP-seq) e abordagens não dependentes de anticorpos.

LC-MS/MS destaca-se pela sua notável sensibilidade e especificidade, permitindo a quantificação precisa de DNA 6mA com uma sensibilidade que chega até um em dez milhões. Este método discrimina adequadamente entre DNA 6mA e RNA m6A ou outras modificações do ADN. No entanto, uma preparação meticulosa da amostra é imperativa para erradicar potenciais contaminações, particularmente de bactérias, que poderiam resultar em falsos positivos.

técnicas dependentes de anticorpos, como imunoblotting e imunofluorescência, embora menos sensíveis em comparação com LC-MS/MS, oferecem simplicidade e utilidade generalizada na investigação de 6mA. No entanto, os anticorpos atuais carecem de discriminação entre o DNA 6mA e RNA m6A ou m6Am, necessitando da remoção rigorosa da contaminação por RNA para evitar resultados espúrios.

O DIP-seq surge como uma abordagem robusta, amalgamando imunoprecipitação com sequenciação, facilitando a deteção e quantificação precisa da distribuição de 6mA ao longo do genoma. No entanto, a otimização da especificidade dos anticorpos para sistemas experimentais individuais é fundamental, enquanto a abundância de 6mA desempenha um papel crucial no enriquecimento bem-sucedido.

Métodos não dependentes de anticorpos desempenham um papel fundamental na validação de descobertas dependentes de anticorpos e na mitigação de sinais não específicos. Um desses métodos envolve a utilização de endonucleases de restrição sensíveis à metilação para clivar o DNA, mas a sua dependência de motivos específicos de DNA limita a sua versatilidade. Outra via promissora é a sequenciação de terceira geração, exemplificada pelo SMRT-seq, que aproveita as propriedades cinéticas da DNA polimerase durante a replicação para detectar 6mA. Embora o SMRT-seq tenha demonstrado sucesso na deteção de 6mA em mamíferos e plantas, surgem desafios devido à baixa abundância de 6mA, necessitando de enriquecimento e uma cobertura de sequenciação robusta.

2. Quais organismos contêm 6mA?

A marca epigenética, N6-metiladenina (6mA), está distribuída de forma ubíqua em várias formas de vida, ocorrendo mais frequentemente em procariotas, embora também tenha sido detetada em certas espécies eucariotas. Neste contexto, delineamos alguns organismos reconhecidos pela sua posse de modificações 6mA:

No reino dos procariotos, as modificações 6mA representam uma forma predominante de modificação do ADN, aparecendo extensivamente em várias espécies bacterianas, como Escherichia coli e Clostridium perfringens, além de subconjuntos do filo das arqueias, incluindo Metanobacterium e Sulfolobus solfataricus.

Voltando a atenção para os eucariotos, a descoberta de modificações 6mA neste domínio foi algo adiada, no entanto, estudos recentes confirmaram a sua existência em organismos selecionados:

• Levedura: Certas espécies de levedura, como Saccharomyces cerevisiae, são conhecidas por apresentarem modificações de 6mA.
• Nematodes: O organismo eucariótico, Caenorhabditis elegans, apresenta modificações de 6mA.
• Moscas da fruta: Evidências sugerem a presença de modificações de 6mA dentro do genoma de Drosophila melanogaster.
• Plantas: Várias plantas, como Arabidopsis thaliana, exibem modificações de 6mA.

Em linha com os avanços nas tecnologias de sequenciação, a vigilância das modificações de 6mA em espectros mais amplos de organismos eucarióticos continua a intensificar-se. Espera-se que futuras descobertas aumentem ainda mais a lista de organismos conhecidos por conter modificações de 6mA.

3. Como funciona a sequenciação de DNA 6mA?

A sequenciação de DNA 6mA envolve tipicamente várias etapas: extração de DNA, fragmentação, enriquecimento de fragmentos de DNA modificados por 6mA, preparação da biblioteca, sequenciação de alto rendimentoe análise computacional. Vários métodos de enriquecimento, como a imunoprecipitação baseada em anticorpos ou a rotulagem química, podem ser utilizados para capturar seletivamente fragmentos de ADN modificados por 6mA antes da sequenciação.

4. Como é decifrada a dados de sequenciamento de DNA 6mA?

A análise de dados de sequenciação de DNA 6mA abrange geralmente o processamento preliminar de leituras de sequenciação brutas, o alinhamento ao genoma de referência, a identificação de locais de modificação 6mA, a análise diferencial entre condições experimentais e a anotação funcional de regiões personalizadas para 6mA. Várias ferramentas bioinformáticas e pacotes de software estão disponíveis para facilitar cada etapa do processo analítico.

5. Quais são os desafios associados à sequenciação de DNA 6mA?

Os desafios na sequenciação de DNA 6mA incluem o enriquecimento eficiente de fragmentos de DNA modificados por 6mA, a deteção precisa de locais de 6mA entre outras modificações de DNA e a interpretação dos dados de sequenciação para decifrar o significado funcional das modificações de 6mA. Além disso, a variabilidade técnica e bioinformática as complexidades podem representar desafios na análise e interpretação de dados.

N⁶modificação de DNA N6-metiladenina no genoma humano

Revista: Célula Molecular

Fator de impacto: 15,280

Publicado: 19 de julho de 2018

Fundos

Emergindo de uma extensa história de pesquisa sobre 5mC, amplamente apoiada pela sua ocorrência generalizada em eucariotos, a atenção acadêmica ao 6mA tem estado principalmente encerrada dentro de limites procarióticos. No entanto, os recentes avanços nas tecnologias de sequenciamento profundo abriram as portas para localizar possíveis vestígios de 6mA em determinados domínios eucariotos, despertando assim novas investigações sobre o seu papel consequente na regulação genética e na herança epigenética. O exame referido aqui utilizou a precisão de Sequenciação SMRT da PacBio tecnologia para revelar os vestígios de 6mA no genoma humano, com uma ênfase particular no DNA das mitocôndrias.

Métodos

Resultados

1. A Modificação 6mA do DNA Ocorre no Genoma Humano

O estudo utilizou dados de sequenciação PacBio para identificar mais de 880.000 locais de modificação 6mA no genoma humano, com uma densidade de aproximadamente 0,051% do total de adeninas. Esta densidade foi considerada inferior em humanos em comparação com certos outros organismos, como fungos, Chlamydomonas e C. elegans, mas semelhante à encontrada em Drosophila e porcos. A validação adicional utilizando sequenciação de imunoprecipitação de 6mA (6mA-IP-seq) e cromatografia líquida-espectrometria de massa em tandem (LC-MS/MS) confirmou a presença de 6mA no DNA genómico humano.

A distribuição de locais de 6mA ao longo do genoma humano variou, com uma maior densidade observada no DNA mitocondrial em comparação com os cromossomos autossómicos. Os cromossomos X e Y exibiram uma menor densidade de 6mA, contrastando com os níveis mais elevados de modificações de DNA 5mC. O estudo também identificou diferenças nos níveis de modificação de 6mA em diferentes regiões cromossómicas, com um enriquecimento observado na categoria de nível de modificação intermédia. Além disso, as distribuições cromossómicas de fragmentos de DNA contendo 6mA identificados por diferentes técnicas mostraram-se consistentes.

Figura 1. Distribuição dos Locais de 6mA no Genoma Humano.

2. 6mA Está Significativamente Enriquecido em Regiões de Exão

Esta pesquisa intrigante analisou a distribuição de modificações de 6mA em zonas funcionais dentro do genoma humano, delineando que a preponderância destes locais estava situada em regiões intrónicas e intergénicas. Uma substancial enriquecimento de 6mA foi discernido dentro de domínios codificadores de exões, sugerindo um papel putativo na modulação da expressão génica. Este enriquecimento permaneceu robusto e consistente quando analisado através de diversas técnicas de sequenciação, demonstrando a sua independência da variabilidade nos níveis de sensibilidade dos métodos. No entanto, em contraste com as descobertas em outros organismos modelo, como C. reinhardtii, houve uma ausência de enriquecimento discernível de 6mA em torno dos locais de iniciação e terminação da transcrição, levando assim a uma investigação mais aprofundada neste campo.

3. N6AMT1 é uma Metiltransferase para 6mA no Genoma Humano

O estudo teve como objetivo identificar a metiltransferase responsável pela modificação de 6mA no ADN em humanos. A metiltransferase de ADN específica para adenina N6 (N6AMT1) foi identificada com base na sua semelhança com metiltransferases de ADN 6mA bacterianas e no seu potencial papel como uma metiltransferase dependente de S-adenosil-l-metionina (AdoMet). O silenciamento de N6AMT1 levou a uma diminuição nos níveis de modificação de 6mA no ADN, enquanto a superexpressão aumentou esses níveis tanto em experimentos in vivo como in vitro. A N6AMT1-Flag recombinante aumentou eficientemente os níveis de modificação de 6mA em substratos de oligonucleotídeos sintéticos in vitro, um efeito abolido pela mutação do motivo catalítico conservado NPPY. Além disso, a deleção de N6AMT1 resultou em níveis reduzidos de 6mA no ADN genómico, que foram recuperados pela expressão ectópica da N6AMT1 tipo selvagem, mas não de um mutante que carecia do motivo NPPY. Estas descobertas estabelecem coletivamente a N6AMT1 como a metiltransferase responsável pela modificação de 6mA no ADN do genoma humano.

Figura 2. N6AMT1 é uma metiltransferase para a metilação de 6mA no DNA humano, e NPPY é o motivo catalítico de N6AMT1.

4. A Diminuição dos Níveis de 6mA do DNA Genómico Promove a Tumorigenese

A investigação científica aprofundou-se nas implicações da modificação de 6mA no DNA sobre a tumorigenese, modulando a expressão de N6AMT1 e ALKBH1 dentro de células malignas. Uma consequência intrigante da supressão de N6AMT1, que resultou na diminuição das concentrações de 6mA no DNA genómico celular, foi a promoção de propriedades tumorígenas, como a proliferação celular, a origem de colónias, a migração e a invasão; enquanto que uma N6AMT1 sobre-regulada contrariou esses processos. Por outro lado, a supressão de ALKBH1, causando um aumento nas concentrações de 6mA no DNA genómico celular, impediu essas propriedades tumorígenas, que foram novamente sentidas de forma inversa com a sobre-expressão de ALKBH1. Validações in vivo convergiram com estas observações, evidenciadas pelo progresso tumoral acelerado em xenotransplantes que hospedavam células com N6AMT1 suprimido, e uma tendência oposta de progresso tumoral naqueles que hospedavam células com ALKBH1 suprimido. Nódulos metastáticos manifestaram-se nos pulmões de camundongos, refletindo os perfis de expressão de N6AMT1 e ALKBH1. A previsão do risco de mortalidade relacionada com o câncer, medida pela análise de sobrevivência de Kaplan-Meier, foi aumentada em camundongos portadores de xenotransplantes com N6AMT1 suprimido, enquanto mostrou uma diminuição naqueles com xenotransplantes de ALKBH1 suprimido. Os resultados de ensaios de resgate utilizando variantes selvagens e mutantes de N6AMT1 e ALKBH1 reforçaram estas observações. Coletivamente, estes achados apontam para uma hipótese esclarecedora em que a diminuição da modificação de 6mA no DNA genómico dentro de células cancerígenas humanas tem o potencial de amplificar a tumorigenese.

Figura 3. Diminuição do Nível de Modificação Genómica de 6mA Promove a Tumorigenese

Figura 4. Aumento do Nível de Modificação Genómica 6mA Inibe a Tumorigenese

Conclusão

A investigação académica em questão esforçou-se por discernir a ocorrência e relevância das modificações de N6-metiladenina (6mA) no ADN nas células humanas, consideradas principalmente como um fenómeno característico de procariotos antes deste estudo. Através da deteção de mais de 880.000 locais de 6mA que abrangem o genoma humano e da realização de uma avaliação abrangente da sua distribuição e implicações funcionais, a pesquisa teve sucesso em descobrir o papel que o 6mA desempenha na regulação genética. Notavelmente, as enzimas denominadas N6AMT1 e ALKBH1 emergiram como contribuintes integrais na administração da dinâmica das modificações de 6mA. De importância crítica foi a descoberta de que as flutuações nos níveis de 6mA estavam intrinsecamente ligadas à génese do câncer, o que sugeriu o potencial valor do 6mA como biomarcador e possível ponto de apoio terapêutico na gestão de doenças cancerígenas.

Referência:

1. Xiao C L, Zhu S, He M, et al. Modificação de DNA N6-metiladenina no genoma humano. Célula molecular, 2018, 71(2): 306-318. e7.