Sequenom MassARRAY iPLEX Gold

iPLEX® Gold é uma tecnologia líder para Genotipagem de SNPsO sistema MassARRAY é amplamente utilizado para mapeamento fino e validação de GWAS estudos de ligação, bem como testes genéticos de rotina de painéis de SNP de interesse. Genotipagem de SNPs MassARRAY combina os benefícios de uma química de extensão de primer simples e precisa com espectrometria de massa MALDI-TOF de última geração para caracterizar rapidamente e de forma económica genótipos com os mais altos níveis de reprodutibilidade. O ensaio iPLEX Gold, utilizado em centenas de publicações, permite rotineiramente desenhar ensaios a um nível de multiplexação de até 40-plex, oferecendo um elevado nível de flexibilidade.

A tecnologia de deteção iPLEX facilita a designação de ensaios rotineiros a um nível multiplex de 36-plex, oferecendo um elevado grau de flexibilidade e eficiência de custos para cada genótipo. A metodologia química iPLEX Single Base Extension (SBE) apresenta um elevado nível de precisão e reprodutibilidade (>99% de taxa de chamada e >99,7% de precisão em testes validados), além de uma deteção de frequência alélica tão baixa quanto 5%. Isto permite alcançar limiares de chamada rigorosos e um desempenho superior a um alto nível de multiplexação.

O Sistema MassARRAY® simplifica habilmente o processo de deteção de 10 a 400 Polimorfismos de Nucleotídeo Único (SNPs) por amostra, permitindo assim a análise de uma variedade de amostras, com quantidades que variam de algumas poucas a várias centenas por dia. Possui funcionalidade autónoma, mas também a capacidade de interagir e integrar-se perfeitamente com Sequenciação de Nova Geração (NGS) plataformas. Este intrincado sistema de compatibilidade acelera significativamente o procedimento de análise genética. Introduzido no início do novo milénio em 2000, o Sistema MassARRAY tem sido utilizada de forma séria e ampla numa variedade de aplicações genómicas, cada uma com as suas próprias complexidades e exigências. Estas aplicações abrangem mapeamento fino, o processo de validação de Estudos de Associação em Larga Escala do Genomaanálises de ligação intrincadas, bem como as análises genéticas convencionais de SNPs e mutações somáticas incipientes.

Destaques:

Flexibilidade:

• Seleção livre de locais SNP de interesse
• Liberdade para escolher o número e a posição das amostras em um único chip
• Liberdade para emparelhar amostras e locais SNP num único chip

Precisão:

• Deteção direta do peso molecular do alvo, com uma precisão superior a 99,7%
• A tecnologia de espectrometria de massas pode detectar de forma flexível falhas em experimentos de PCR ou a presença de genes tri-alélicos.

Alto rendimento:

• Até 384 amostras podem ser multiplexadas em um único experimento iPLEX GOLD em um único chip.
• Podem ser alcançadas até 40 reações por poço de reação.
• Podem ser realizados até cem mil análises de genótipos por dia.

Custo-efetividade:

• Sem necessidade de rotulagem fluorescente, reduzindo significativamente os custos.
• Mesmo em cenários de baixo rendimento, o custo de cada análise de genótipo continua a ser baixo.

Conteúdo do Serviço

• Os clientes fornecem ADN genómico ou amostras biológicas e especificam os locais de SNP a serem detetados.
• Desenho de primers, incluindo primers de amplificação PCR e primers de extensão de base única.
• Design de reações multiplex.
• Amplificação por PCR, tratamento com SAP, extensão de base única.
• Preparação de arrays manchados para deteção.
• Deteção por espectrometria de massa MALDI-TOF.
• Análise de dados e fornecimento de relatórios de genótipo.

Aplicações:

• Estudo de associação de genoma completo validação
• Análise individual de genótipos SNP
• Análise de haplótipos
• Análise da frequência de sítios de genes SNP
• Análise epigenética
• Análise de mutações somáticas