Nova Geração de Sequenciação de cDNA -- Oxford Nanopore Introduz Novos Kits de Sequenciação de cDNA

4 de fevereiro de 2019

A Oxford Nanopore lançou os seus dois novos Kits de cDNA '109' para a sua tecnologia de sequenciação em tempo real e escalável. Os novos kits oferecem alta capacidade de processamento enquanto geram sequências completas de cadeias de cDNA de comprimento total, com uma opção de entrada baixa de apenas 1ng de RNA PolyA+.

Os dois novos kits agora disponíveis são os Kits de Sequenciação de cDNA Direto (SQK-DCS109) e de cDNA PCR (SQK-PCS109). Em combinação com atualizações nas plataformas de sequenciação Oxford Nanopore e software, a sequenciação de cDNA por nanoporo proporciona um enriquecimento eficaz para transcritos de comprimento total (cDNA-PCR). No caso do kit de cDNA Direto, a PCR não é necessária — eliminando viés, enquanto o kit de cDNA-PCR permite alta capacidade de processamento a partir de uma baixa entrada de RNA (apenas 1 ng de RNA PolyA+) e oferece a opção de começar a partir de RNA total.

Os novos kits de cDNA estão disponíveis para uso em todos os dispositivos Oxford Nanopore, permitindo que todos os tipos de utilizadores gerem rendimentos muito elevados de dados transcriptómicos para a descoberta de novos isoformas em alta resolução, identificação de transcritos de baixo número de cópias e sequenciação de novo de todo o transcriptoma com alta cobertura.

O novo método de sequenciação de cDNA permite aos utilizadores sequenciar todo o transcriptoma com alta cobertura em uma única célula de fluxo MinION (10-15 milhões de leituras x transcritos de comprimento total), com capacidades de rendimento substancialmente mais altas no PromethION (mais de 60 milhões de leituras x transcritos de comprimento total por célula de fluxo), ou ensaios rápidos e menores no Flongle. Isso facilita novas percepções biológicas numa ampla gama de aplicações.

Aprofundar-se no transcriptoma permite que os investigadores compreendam melhor como o ADN de um organismo é interpretado em qualquer momento. Isso pode informar melhor o tratamento na saúde e fornecer um método rápido de identificação de vírus.

Ambos os kits já estão disponíveis para compra no site da Oxford Nanopore.