Serviço de Microarray de LncRNA

A CD Genomics apresenta um extenso serviço de perfilagem de microarrays de LncRNA (RNA longo não codificante), utilizando algumas das plataformas mais avançadas disponíveis na área. As nossas metodologias garantem uma precisão e sensibilidade incomparáveis. Através de rigorosos procedimentos de controlo de qualidade em etapas, estamos comprometidos em fornecer resultados altamente fiáveis e reproduzíveis.

Introdução ao Microarray de LncRNA

As lncRNAs são uma classe diversificada e extensa de moléculas de RNA transcritas, cada uma com mais de 200 nucleotídeos de comprimento, que não codificam proteínas. A sua expressão é regulada de forma intricada durante o desenvolvimento e pode ser altamente específica para certos tecidos ou tipos celulares. Uma fração notável de lncRNAs reside exclusivamente no núcleo.

Acredita-se que estas moléculas desempenhem papéis regulatórios significativos, adicionando novas camadas de complexidade à nossa compreensão da regulação genómica. A especificidade e as funções regulatórias das lncRNAs destacam a sua importância na intrincada rede de expressão génica.

A tecnologia de microarray de lncRNA destaca-se como uma ferramenta sofisticada para analisar a expressão de lncRNA em diversos cenários biológicos. Ao contrário de Sequenciação de RNA, que podem falhar com lncRNAs de baixa abundância, as microarrays destacam-se na profilagem de alto rendimento. Estas matrizes são projetadas para detectar milhares de lncRNAs juntamente com mRNAs codificadores de proteínas em um único experimento. Ao utilizar designs de sondas avançados e extensas bases de dados de lncRNA, as microarrays permitem uma avaliação aprofundada das dinâmicas de expressão de lncRNA.

A CD Genomics oferece um serviço de microarray de lncRNA de primeira linha que combina tecnologia de ponta com rigoroso controlo de qualidade. O serviço abrange todas as etapas, desde a preparação da amostra e hibridação do array até uma análise de dados minuciosa, garantindo que os resultados sejam de alta qualidade e fiáveis.

Vantagens e Características do Microarray de LncRNA

• Sensibilidade e Precisão Excecionais: Microarrays detetar lncRNAs de baixa abundância com alta precisão, superando o RNA-seq na quantificação dessas expressões subtis.
• Cobertura de Dados AbrangenteA CD Genomics utiliza bases de dados abrangentes e atualizadas, como GENCODE e RefSeq, garantindo uma cobertura ampla e atual de lncRNA.
• Anotação e Análise AprofundadasO serviço inclui anotação e análise detalhadas, abrangendo o contexto genómico e a localização subcelular para elucidar as funções das lncRNA.
• Soluções PersonalizadasA CD Genomics oferece soluções de microarrays personalizáveis para atender a necessidades de pesquisa específicas, proporcionando opções flexíveis e personalizadas.
• Obtenha dados de alta qualidade rapidamente e sem complicações.
• Um relatório final único com análise de dados básica gratuita.
• Dados e relatórios entregues de forma segura.

Aplicações do Microarray de LncRNA

• Perfilagem global de longas transcrições
• Investigação sobre o câncer
• Doenças cardiovasculares
• Distúrbios neurológicos

Fluxo de Trabalho do Serviço de Microarranjo de LncRNA

Especificações do Serviço

	Requisitos de Amostra Espécies: humano, rato, ratazana Amostras de RNA e tecidos ou espécimes celulares bem preservados RNA≥200 ng Nota: Os montantes de amostra são apresentados apenas para referência. Para informações detalhadas, por favor contacte-nos com os seus pedidos personalizados.
Clique	Estratégia de Sequenciamento pode consultar as seguintes recomendações e serviço personalizado.
	Análise Bioinformática Fornecemos múltiplas análises de bioinformática personalizadas, incluindo, mas não se limitando a: análise GO Análise de vias Análise diferencial da expressão de lncrna Análise de expressão gênica diferencial Nota: Os dados de saída e os conteúdos de análise recomendados apresentados são apenas para referência. Para informações detalhadas, por favor contacte-nos com os seus pedidos personalizados.

Recomendações e Serviço Personalizado

Tabela 1 Microarrays de expressão de LncRNA da Agilent

Pipeline de Análise

Entregáveis

• Os dados brutos
• Resultados experimentais
• Relatório de análise de dados
• Detalhes na Microarray de LncRNA para a sua escrita (personalização)

CD Genomics também pode ajudar a criar o seu microarray de LncRNA personalizado. Estamos prontos para ajudá-lo com as suas necessidades de microarray personalizado, seja um design padrão ou algo mais criativo.

Portanto, o que precisa é apenas enviar-nos as suas amostras, podemos oferecer-lhe o relatório final qualificado. Para mais detalhes, não hesite em contactar-nos com qualquer dúvida a qualquer momento, preenchendo um formulário sem compromisso. pedido de cotação.

Os resultados parciais estão mostrados abaixo:

1. Quais são os desafios associados à deteção de lncRNAs em comparação com mRNAs?

A deteção de RNAs não codificantes longos (lncRNAs) apresenta desafios distintos em relação aos RNAs mensageiros (mRNAs), principalmente devido aos seus níveis de expressão inerentemente mais baixos e à sua especificidade tecidual pronunciada. As características únicas dos lncRNAs, como a sua baixa abundância e a vasta diversidade de isoformas, introduzem complexidade adicional à sua análise. Para superar eficazmente estes obstáculos, a nossa microarranjos foram meticulosamente projetados para garantir a deteção e quantificação precisas de lncRNAs, apesar da sua natureza intrincada.

2. Como é que a sensibilidade das microarrays de lncRNA se compara a Sequenciação de RNA?

Em termos de sensibilidade, as microarrays de lncRNA exibem um desempenho superior na deteção de lncRNAs de baixa abundância quando comparadas ao sequenciamento de RNA. O sequenciamento de RNA pode enfrentar problemas de precisão, particularmente devido a altas taxas de erro e aos níveis de expressão inerentemente baixos desses transcritos. Em contraste, as nossas microarrays fornecem medições fiáveis com mínima suscetibilidade a variações causadas pela baixa abundância de transcritos, melhorando assim a sensibilidade geral da deteção.

3. Podem as microarrays de lncRNA detetar diferentes isoformas de transcritos?

Absolutamente, os nossos microarrays de lncRNA são proficientes em diferenciar e detectar várias isoformas. Ao contrário dos mRNAs, os lncRNAs são conhecidos por gerar múltiplas isoformas, cada uma com papéis biológicos distintamente únicos. O nosso design avançado de microarray garante a identificação e quantificação precisas dessas diversas isoformas, oferecendo assim uma compreensão abrangente da funcionalidade dos lncRNAs.

4. Como é que a precisão da quantificação de lncRNA em microarrays se compara com os métodos de sequenciação?

Quando se trata da quantificação de lncRNAs de baixa abundância, a tecnologia de microarrays oferece uma maior precisão em comparação com os métodos de sequenciação, que muitas vezes são prejudicados por taxas de erro mais elevadas e limitações de cobertura. Os nossos microarrays são rigorosamente projetados para mitigar esses problemas, resultando na disponibilização de dados mais fiáveis e abrangentes que melhoram significativamente a precisão da quantificação de lncRNA.

5. Que soluções personalizadas estão disponíveis para a análise de microarrays de lncRNA?

Oferecemos soluções personalizadas de microarrays de lncRNA que atendem a necessidades de pesquisa específicas. Quer os seus requisitos envolvam arrays standard ou designs inovadores, as nossas opções personalizáveis garantem que os nossos serviços estão precisamente alinhados com os seus objetivos de pesquisa. Esta flexibilidade facilita a aquisição de insights genómicos direcionados e abrangentes, promovendo assim os seus esforços científicos.

Análise Integrada dos Perfis de Expressão de lncRNA e mRNA Indica Alterações Relacionadas com a Idade no Menisco

Revista: Fronteiras em biologia celular e do desenvolvimento
Fator de Impacto: 5,206
Publicado: 10 de março de 2022

Fundo

O menisco, crucial para a função do joelho, deteriora-se com a idade, aumentando o risco de osteoartrite devido a alterações como o espessamento do colágeno. As long non-coding RNAs (lncRNAs) são importantes no envelhecimento dos tecidos e podem contribuir para a degeneração do menisco. Para explorar isso, o estudo analisou perfis de expressão de lncRNA e mRNA em meniscos jovens e envelhecidos usando microarranjo análise, seguida de bioinformática para identificar moléculas e vias-chave envolvidas nas alterações do menisco relacionadas com a idade.

Materiais e Métodos

Resultados

O estudo utilizou o Arraystar Human lncRNA e mRNA Array para comparar tecidos de menisco de grupos jovens e de envelhecimento (n = 4/grupo). Foram identificados 1608 lncRNAs expressos diferencialmente e 1809 mRNAs expressos diferencialmente. Os padrões de expressão foram visualizados com gráficos de vulcão e agrupamento hierárquico.

FIGURA 1. Identificação de lncRNAs e mRNAs DE.

As análises de GO e de via de 1809 mRNAs diferencialmente expressos destacaram vias-chave envolvidas na lesão da cartilagem, incluindo TGF-beta, Wnt e PI3K-Akt. O estudo identificou 18 mRNAs significativamente alterados, com uma notável downregulação de FGF6 e PPP2R5C.

FIGURA 2. Análise de Enriquecimento Funcional de mRNAs DE.

Uma análise da rede ceRNA utilizando 19 mRNAs diferencialmente expressos (DE) e 46 lncRNAs DE identificou 98 nós e 229 arestas. A rede, construída com o Cytoscape, destacou a lncRNA POC1B-AS1, que foi examinada mais detalhadamente quanto às suas interações com miRNAs e genes-alvo em uma sub-rede detalhada.

FIGURA 3. Análise de CeRNA.

Conclusão

Este estudo encontrou alterações significativas na expressão de lncRNA e mRNA no menisco envelhecido, incluindo a diminuição dos níveis de MMP-2 e COL1A2. Vias-chave como Hippo e TGF-beta estão envolvidas na degeneração meniscal. Expressões anormais de lncRNA sugerem novos alvos terapêuticos para o tratamento da degeneração meniscal.

Referência

1. Ai LY, Du MZ, Chen YR, et al. Análise integrada dos perfis de expressão de lncRNA e mRNA indica alterações relacionadas com a idade no menisco. Fronteiras em biologia celular e do desenvolvimento. 2022, 10:844555.