18 de fevereiro de 2021
Os investigadores desenvolveram um novo protocolo de sequenciação de DNA integrado genético/epigenético conhecido como MultiMMR, que pode identificar a presença e a causa da deficiência de reparo de desajustes (MMR) num único teste a partir de uma pequena amostra de DNA em cânceres de cólon, endométrio e outros. Esta alternativa a fluxos de teste complexos e em múltiplas etapas também pode determinar causas de deficiência de MMR frequentemente ignoradas pelos testes clínicos atuais. Os seus resultados são apresentados no The Journal of Molecular Diagnostics, publicado pela Elsevier.
Os genes MMR monitorizam e repararam erros que podem ocorrer na replicação e recombinação celular normais. Em alguns cancros hereditários e adquiridos, um ou mais dos genes MMR estão desativados. "O impacto do MultiMMR é amplo. Tumores com deficiência de MMR respondem bem a novas imunoterapias contra o câncer," explica o investigador principal Trevor J. Pugh, PhD, Departamento de Biofísica Médica, Universidade de Toronto; Centro de Câncer Princess Margaret, Rede de Saúde da Universidade; e Instituto de Pesquisa do Câncer de Ontário, Toronto, ON, Canadá. "Determinar se um indivíduo tem uma forma hereditária de deficiência de MMR também pode permitir que os clínicos inscrevam pacientes em vigilância ativa, implementem estratégias de redução de risco e forneçam testes genéticos a parentes – potencialmente melhorando os resultados para os pacientes."
Os testes clínicos padrão para a deficiência de MMR podem ser inconsistentes, exigindo múltiplos testes e tipos de especialização, resultando em cuidados subótimos para os pacientes. Os testes de sequenciação de nova geração ganharam popularidade e estão a ser utilizados em laboratórios clínicos. No entanto, não identificam todas as variações genéticas para a deficiência de MMR e testes adicionais são frequentemente necessários.
O MultiMMR testa simultaneamente a metilação do promotor, mutações, estado do número de cópias, perda de heterozigosidade neutra em cópias e instabilidade de microssatélites a partir de uma pequena quantidade de DNA. Neste estudo, os investigadores sequenciaram DNA de 142 espécimes (82 amostras normais e 60 amostras tumorais) de 82 pacientes com cânceres colorretais, endometriais e cerebrais associados ao MMR. Como controlo positivo, os resultados de 45 pacientes foram comparados com testes clínicos anteriores utilizando ensaios convencionais. Eles também utilizaram o MultiMMR para perfilar um controlo de DNA disponível comercialmente que inclui 11 variantes que são difíceis de detectar com sequenciação de nova geração.
Para detectar a presença de deficiência de MMR, as análises de metilação do promotor MultiMMR e de instabilidade de microssatélites encontraram 95 por cento e 97 por cento de concordância com os testes clínicos, respetivamente. Na deteção de variantes responsáveis pela deficiência de MMR, o MultiMMR correspondeu aos resultados dos testes clínicos em 23 dos 24 casos. O teste identificou todas as 11 mutações na mistura sintética em múltiplas corridas de sequenciação e identificou a deficiência de reparo de desajustes em 29 pacientes com testes incompletos ou inconclusivos. O painel conseguiu identificar causas de MMR frequentemente perdidas pela atual cascata clínica.
"Mostramos que a presença e a causa do MMR podem ser determinadas num único teste, a partir de um único alíquota de DNA, aproveitando assim da melhor forma o tecido disponível, otimizando os fluxos de trabalho e melhorando a reportação integrada para o câncer de Lynch e cânceres hereditários relacionados," comenta a autora principal Leslie Oldfield, MSc, Departamento de Biofísica Médica, Universidade de Toronto; e Centro de Câncer Princess Margaret, Rede de Saúde Universitária, Toronto, ON, Canadá.
Os investigadores notam que os atuais protocolos de teste em cascata podem não ser capazes de atender à crescente demanda por testes tumorais universais em pacientes com câncer colorretal e endometrial. Muitos testes de sequenciação de nova geração não analisam a instabilidade de microssatélites e a metilação do promotor juntamente com mutações somáticas, por exemplo.
"A elegibilidade para a imunoterapia é frequentemente condicionada ao estado de MMR, por isso testes oportunos e robustos são importantes," acrescenta a Sra. Oldfield. "O MultiMMR simplifica o processo e distingue o tipo de deficiência de MMR com um tempo de resposta melhorado, pode escalar bem com o aumento das demandas e pode fornecer aos clínicos informações importantes para informar a gestão do paciente e as decisões de tratamento."
Este estudo foi apoiado pelo Programa de Cátedras de Investigação do Canadá, pelo Prémio de Investigador Sénior do Instituto de Investigação do Cancro de Ontário IA-063, pelo Fundo de Medicina Personalizada do Gattuso-Slaight da Fundação do Cancro Princess Margaret, pela bolsa 704038 do Instituto de Investigação da Sociedade Canadiana do Cancro, pela BioCanRx e pela bolsa 32383 do Fundo de Oportunidade para Líderes da Fundação Canadense para a Inovação.
Mais informações em: https://scitechdaily.com/new-genetic-test-effectively-screens-for-hereditary-cancers/
DOI: 10.1016/j.jmoldx.2020.11.006
Apenas para fins de investigação, não se destina a diagnóstico clínico, tratamento ou avaliações de saúde individuais.
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