Caracterização da Sequência do Genoma Completo do Cloroplasto de Espécies de Dalbergia e Suas Implicações Filogenéticas

31 de dezembro de 2019

Yun Song, Yongjiang Zhang, Jin Xu, Weimin Li & MingFu Li

Relatórios Científicos volume 9Número do artigo: 20401 (2019)

Resumo

O género de plantas pantropicais Dalbergia compreende aproximadamente 250 espécies, a maioria das quais possui um elevado valor económico e ecológico. No entanto, estas espécies estão entre as mais ameaçadas devido à exploração ilegal e ao comércio de madeira. Para aplicar a legislação de proteção e garantir uma conservação eficaz de Dalbergia espécies, a identidade da madeira que está a ser comercializada deve ser validada com precisão. Para a identificação rápida e precisa de Dalbergia espécies e avaliação das relações filogenéticas, seria altamente desejável desenvolver códigos de barras de DNA mais eficazes para estas espécies. Neste estudo, sequenciámos e comparamos os genomas de cloroplastos de nove espécies de Dalbergia. Descobrimos que estes genomas de cloroplastos eram conservados em relação ao tamanho do genoma, estrutura e conteúdo genético, apresentando baixa divergência de sequência. Identificámos oito hotspots de mutação, nomeadamente, seis regiões de espaçador intergénico (trnL-trnT, atpA-trnG, rps16-accD, petG-psaJ, ndhF-trnL e ndhG-ndhI) e duas regiões codificantes (ycf1a e ycf1b), como potenciais códigos de barras de DNA para DalbergiaAs análises filogenéticas baseadas em dados do genoma completo do cloroplasto forneceram a melhor resolução de Dalbergiae a análise filogenética das Fabaceae mostrou que Dalbergia era irmã de Arachis. Com base na comparação de genomas de cloroplastos, identificámos um conjunto de marcadores altamente variáveis que podem ser desenvolvidos como códigos de barras de DNA específicos.

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