PacBio HiFi Sequenciação de Metilação Perguntas e Respostas

Perguntas Gerais

A sequenciação PacBio tem 4 etiquetas fluorescentes, que estão marcadas com 4 tipos de dNTP, e a sua polimerase está ancorada na parte inferior do chip de sequenciação; quando a cadeia de DNA se liga à enzima, a sequenciação é realizada, e durante a sequenciação, o dNTP fluorescente forma um complexo com a enzima e o molde de DNA, que se ligará brevemente. Durante este processo, quando a polimerase encontra A, C e outras bases metiladas no molde, a taxa de polimerização será significativamente mais lenta. e as características espectrais correspondentes mudarão, o que torna possível medir diretamente a metilação de A, metilação de C, hidroximetilação de C, etc.

Como mencionado acima, a deteção HiFi de metilação 5mC tem uma baixa exigência de profundidade, ampla cobertura, e pode ser faseada em metilação, o que nos permite medir os dados HiFi uma vez para completar tanto a montagem do genoma quanto a deteção de variantes e análise de metilação, o que pode fornecer uma ajuda abrangente para a resolução profunda de espécies. Além disso, com base nos resultados da fase de metilação, podemos explorar a metilação diferencial de alelos, rastrear a impressão parental e procurar genes impressos, o que ajudará os investigadores a analisar o mecanismo genético do desenvolvimento de espécies, causas de doenças e fenótipos importantes numa dimensão superior.